More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0112 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0112  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 267 aa  534  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0422  glutamine amidotransferase  79.03 
 
 		 265 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0056  glutamine amidotransferase  75 
 
 		 260 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  73.9 
 
 		 269 aa  364  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  63.4 
 
 		 249 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1012  glutamine amidotransferase  62.55 
 
 		 249 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  61.86 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  57.59 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  58.87 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3704  glutamine amidotransferase  55.17 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.480438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  54.78 
 
 		 248 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4150  glutamine amidotransferase  57.66 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  54.91 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  55.79 
 
 		 261 aa  249  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  53.6 
 
 		 261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  56.95 
 
 		 288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  42.67 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  39.29 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  37.76 
 
 		 236 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  29.2 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  34 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  36.76 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3054  glutamine amidotransferase  35.56 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  42.05 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  32.73 
 
 		 237 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  32.73 
 
 		 237 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  32.5 
 
 		 227 aa  97.1  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  32.5 
 
 		 227 aa  97.1  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  35.75 
 
 		 234 aa  96.3  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  38.61 
 
 		 238 aa  95.5  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  36.32 
 
 		 236 aa  95.5  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  37.31 
 
 		 236 aa  95.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  31.86 
 
 		 245 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  33.99 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  38.06 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  32.67 
 
 		 245 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  35.75 
 
 		 224 aa  92.4  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  34.21 
 
 		 229 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  30.1 
 
 		 243 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3185  glutamine amidotransferase class-I  32.81 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620946 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  41.77 
 
 		 242 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  32.29 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1717  glutamine amidotransferase class-I  39.06 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  36.87 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  32.63 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  39.39 
 
 		 231 aa  90.5  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  39.13 
 
 		 231 aa  90.1  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  35.09 
 
 		 222 aa  89.4  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  38.46 
 
 		 241 aa  89.7  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  29 
 
 		 209 aa  89.4  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  30.26 
 
 		 232 aa  89  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  34.62 
 
 		 239 aa  89  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  40 
 
 		 235 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  31.3 
 
 		 247 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  35 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  34.17 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  33.87 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  34.16 
 
 		 233 aa  87  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  30 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  38.14 
 
 		 222 aa  85.1  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  35.67 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  29.69 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  34.83 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  34.22 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  33.67 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  37.57 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0523  glutamine amidotransferase, class I  37.66 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.947174  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  31.61 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  30.45 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  29.95 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  33.16 
 
 		 228 aa  82  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  33.91 
 
 		 233 aa  82  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  33.33 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  28.76 
 
 		 228 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  41.67 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  32.08 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  29.07 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  39.39 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  36.65 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2673  glutamine amidotransferase  32.37 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  37.43 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1579  glutamine amidotransferase  37.81 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430853  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  30.61 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  32.37 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  32.65 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  36.27 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2631  glutamine amidotransferase  32.37 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0063485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  32.14 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  37.63 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  36.16 
 
 		 232 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2803  glutamine amidotransferase  32.37 
 
 		 239 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  32.91 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2582  glutamine amidotransferase  31.88 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  34.02 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  28.21 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0890  glutamine amidotransferase  30.43 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00279446  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  41.4 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5145  glutamine amidotransferase class-I  29.29 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  34.33 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  37.41 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>