More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0875 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  100 
 
 		 238 aa  495  1e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  52.36 
 
 		 238 aa  265  4e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0523  glutamine amidotransferase, class I  55.41 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.947174  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  49.58 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1960  glutamine amidotransferase class-I  47.64 
 
 		 237 aa  228  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0768  glutamine amidotransferase class-I  47.06 
 
 		 237 aa  224  8e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  35.32 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  35.71 
 
 		 237 aa  119  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  34.19 
 
 		 228 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  33.05 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  34.17 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  34.01 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  31.78 
 
 		 282 aa  112  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  31.49 
 
 		 231 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 228 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  32.59 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  32.65 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  32.72 
 
 		 247 aa  108  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  32.76 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  33.65 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  31.72 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  31.8 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  30.94 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  32.7 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  31.31 
 
 		 237 aa  99.4  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  30.19 
 
 		 245 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  29.2 
 
 		 245 aa  98.6  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  29.31 
 
 		 227 aa  98.2  9e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  37.1 
 
 		 288 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  30.29 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  29.72 
 
 		 245 aa  95.5  7e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  24.9 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  28.39 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  31.89 
 
 		 236 aa  92  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0422  glutamine amidotransferase  35.08 
 
 		 265 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  31.69 
 
 		 231 aa  91.7  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  36.22 
 
 		 237 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  33.81 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  31.61 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  31.55 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  31.55 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  30.08 
 
 		 248 aa  89.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  31.52 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  27.64 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  30.89 
 
 		 232 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4150  glutamine amidotransferase  29.61 
 
 		 254 aa  88.6  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  31.88 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  35.2 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  30.93 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0112  glutamine amidotransferase  34.17 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  34.54 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  32.97 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  29.35 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  30.47 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  28.43 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  29.65 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  37.5 
 
 		 261 aa  86.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  29.27 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  27.36 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3704  glutamine amidotransferase  30.04 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.480438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  27.36 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  34.95 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  32.65 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  30.38 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  32.26 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  35.24 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2673  glutamine amidotransferase  30.38 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  28.19 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  35.57 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2631  glutamine amidotransferase  33.15 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0063485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  28.21 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  34.93 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  31.41 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  35.9 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  33.71 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  39.22 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  32.37 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  28.11 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  30.37 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3185  glutamine amidotransferase class-I  29.23 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2803  glutamine amidotransferase  29.96 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2582  glutamine amidotransferase  29.96 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  28.09 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  35.86 
 
 		 276 aa  81.6  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  28.57 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  29.23 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1012  glutamine amidotransferase  34.9 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  28.16 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  29.06 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  33.51 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  31.61 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  31.61 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  38.78 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  33.85 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  33.17 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  28.42 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  28.81 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  33.52 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>