More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0948 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 233 aa  477  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  60.68 
 
 		 250 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  61.64 
 
 		 243 aa  270  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  46.55 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  46.15 
 
 		 258 aa  200  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  44.44 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  46.15 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  45.02 
 
 		 243 aa  192  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  38.56 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  41.13 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  45.89 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  45.54 
 
 		 248 aa  175  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  42.53 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  42.53 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  41.36 
 
 		 250 aa  164  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  35.93 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  36.09 
 
 		 240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  36.21 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  37.5 
 
 		 243 aa  142  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  38.86 
 
 		 246 aa  138  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  37.61 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  35.91 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  33.2 
 
 		 258 aa  114  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  34.22 
 
 		 236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  35.44 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  34.84 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  37.88 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  35.2 
 
 		 228 aa  101  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  34.9 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  36.52 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  33.33 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  41.61 
 
 		 254 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  35.87 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  34.34 
 
 		 232 aa  98.6  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  34.18 
 
 		 228 aa  98.2  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  40.67 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  34.3 
 
 		 278 aa  96.7  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  34.22 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  34.67 
 
 		 249 aa  95.1  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  34.38 
 
 		 233 aa  95.1  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  32.56 
 
 		 242 aa  92  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  38.95 
 
 		 245 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  32.02 
 
 		 275 aa  91.7  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  33.17 
 
 		 222 aa  89.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  37.04 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31460  GMP synthase family protein  35.43 
 
 		 248 aa  89  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000828647  normal  0.202154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  33.51 
 
 		 231 aa  88.6  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  31.88 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  40.15 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  32.69 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  35.8 
 
 		 276 aa  86.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  36.63 
 
 		 249 aa  85.9  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  30 
 
 		 232 aa  85.1  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  32.78 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  36.02 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  36.69 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  33.53 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03160  glutamine amidotransferase  35.29 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  30.23 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0014  glutamine amidotransferase  34.04 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  27.89 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  34.52 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  34.32 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  31.33 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  32.37 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  28.85 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  29.33 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  31.47 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  30.72 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30350  glutamine amidotransferase  34.32 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  31.72 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2980  glutamine amidotransferase  37.32 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0885879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  34.12 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  35.62 
 
 		 259 aa  78.2  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0523  glutamine amidotransferase, class I  30.33 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.947174  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1289  glutamine amidotransferase  33.81 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0579596  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  29.48 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  31.82 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  28.03 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  29.61 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.623837 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  32.02 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1270  glutamine amidotransferase  35.33 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17353  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3327  glutamine amidotransferase  35.93 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0768  glutamine amidotransferase class-I  26.13 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3704  glutamine amidotransferase  36.02 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.480438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2606  glutamine amidotransferase class-I  32.89 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  35.4 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  29.82 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  28.78 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  33.97 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  37.7 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  32.56 
 
 		 264 aa  72  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2935  glutamine amidotransferase class-I  36.75 
 
 		 249 aa  71.6  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  27.32 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  31.52 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  29.94 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2609  glutamine amidotransferase class-I  33.9 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  33.07 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1183  GMP synthase C terminal domain protein  36.17 
 
 		 523 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.853141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>