More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2745 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 240 aa  495  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  95 
 
 		 240 aa  470  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  55.19 
 
 		 246 aa  261  8e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  54.94 
 
 		 241 aa  258  8e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  45.04 
 
 		 238 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  43.57 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  43.98 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  38.98 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  41.35 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  37.5 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  36.75 
 
 		 237 aa  155  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  33.91 
 
 		 235 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  43.75 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  40.89 
 
 		 243 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  45.96 
 
 		 247 aa  148  8e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  37.08 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  36.09 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  34.73 
 
 		 250 aa  143  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  34.87 
 
 		 250 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 		 258 aa  140  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  36.52 
 
 		 243 aa  138  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  34.27 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  37.1 
 
 		 235 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  33.87 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  29.3 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  34.38 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  28.49 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  33.18 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  32.13 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  37.79 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  36.32 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1289  glutamine amidotransferase  29.65 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0579596  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  31.58 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  28.65 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  29.86 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  33.91 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  33.17 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  35.5 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  28.95 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  29.02 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  33.99 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  33.12 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  36.48 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  30.73 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  39.82 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  37.24 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  28 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  29.83 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  28.65 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  28.5 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  29.83 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0829  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135079  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  33.54 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  29.05 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  29.63 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  28.1 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  37.58 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  32.31 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  30.18 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  33.14 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  29.1 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  38.94 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  33.52 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  31.4 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0749  GMP synthase  35.29 
 
 		 547 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  32.84 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1270  glutamine amidotransferase  32.08 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17353  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  32.95 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3437  glutamine amidotransferase class-I  32.56 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  29.23 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  31.33 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  35.53 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  32.04 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  32.86 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  36.67 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  32.46 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  34.58 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  32.46 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  26.98 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  35.21 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  30.87 
 
 		 513 aa  72.4  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3746  glutamine amidotransferase class-I  35.77 
 
 		 286 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  30.87 
 
 		 513 aa  72.4  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  34.59 
 
 		 254 aa  72  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  27.48 
 
 		 241 aa  72  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  32.86 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1315  glutamine amidotransferase  30.48 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000170552 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0690  GMP synthase subunit A  35.51 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.635266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  33.81 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  33.53 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  34.81 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  29.44 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  31.43 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  34.81 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  34.81 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  31.87 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  26.75 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  30.49 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0014  glutamine amidotransferase  32.24 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14740  glutamine amidotransferase  33.88 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.216669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>