More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1260 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
249 aa  499  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  62.17 
 
 
233 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  41.67 
 
 
242 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  40.95 
 
 
238 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  44.18 
 
 
275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  39.35 
 
 
246 aa  142  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  39.08 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  40.68 
 
 
240 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  35.66 
 
 
241 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  39.22 
 
 
255 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  42.36 
 
 
264 aa  129  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  42.5 
 
 
253 aa  126  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31460  GMP synthase family protein  43.72 
 
 
248 aa  125  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000828647  normal  0.202154 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  34.18 
 
 
249 aa  111  9e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  38.86 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  32.75 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  32.3 
 
 
239 aa  109  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  31.67 
 
 
232 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2935  glutamine amidotransferase class-I  38.34 
 
 
249 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  34.07 
 
 
231 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4908  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  35.78 
 
 
224 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231042  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  31.02 
 
 
229 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  34.33 
 
 
228 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  37.89 
 
 
232 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  41.36 
 
 
237 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  35.09 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  34.55 
 
 
232 aa  98.6  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  33.51 
 
 
237 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  33.51 
 
 
237 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  36.36 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  29.26 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  27.96 
 
 
230 aa  96.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  35.47 
 
 
243 aa  96.3  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  30.26 
 
 
222 aa  95.9  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  31.33 
 
 
236 aa  95.5  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  37.24 
 
 
238 aa  95.1  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  27.11 
 
 
229 aa  93.6  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  36.67 
 
 
258 aa  93.2  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  32.32 
 
 
261 aa  92.8  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  33.85 
 
 
254 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  30.11 
 
 
220 aa  92.4  6e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  34.22 
 
 
237 aa  91.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  38.25 
 
 
250 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  32.51 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  28.51 
 
 
230 aa  89.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  34.9 
 
 
228 aa  89  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  31.69 
 
 
236 aa  87.8  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  34.98 
 
 
236 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  39.49 
 
 
246 aa  88.2  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  38.73 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  34.23 
 
 
228 aa  87  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  36.63 
 
 
250 aa  87  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  33.82 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  36.84 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3054  glutamine amidotransferase  33.85 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  30.04 
 
 
282 aa  86.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  38.67 
 
 
245 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  34.48 
 
 
209 aa  86.3  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  32.97 
 
 
241 aa  85.9  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  36.63 
 
 
233 aa  85.9  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  28.14 
 
 
227 aa  85.1  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  30.93 
 
 
247 aa  85.1  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3704  glutamine amidotransferase  31.66 
 
 
251 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.480438  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  34.52 
 
 
241 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  36.72 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  28.43 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  31.96 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  34.46 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  35.67 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  31.68 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  31.98 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4150  glutamine amidotransferase  32 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  28.64 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  27.71 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  27.14 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  36.16 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0829  glutamine amidotransferase class-I  38.27 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135079  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  33.68 
 
 
234 aa  82  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  30.9 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  34.39 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  37.5 
 
 
240 aa  81.6  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  28.33 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  34.69 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  32.42 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  34.87 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  30.38 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  42.72 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  33.57 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  31.36 
 
 
241 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  31.19 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
227 aa  79.7  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
243 aa  79  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  35.42 
 
 
250 aa  79  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  26.74 
 
 
229 aa  79  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  30.95 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  36.11 
 
 
240 aa  78.6  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  34.84 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  31.63 
 
 
247 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  33.11 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0578431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>