230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0280 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
218 aa  451  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  46.08 
 
 
233 aa  184  7e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  45.54 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  43.09 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  46.93 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2575  glutamine amidotransferase class-I  35.98 
 
 
213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  36.07 
 
 
220 aa  137  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  41.99 
 
 
229 aa  137  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  40.96 
 
 
230 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  39.01 
 
 
239 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  36.62 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  40.7 
 
 
231 aa  125  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  35.21 
 
 
229 aa  123  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  41.34 
 
 
238 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  39.57 
 
 
232 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  35.5 
 
 
227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  36.92 
 
 
231 aa  118  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  37.43 
 
 
233 aa  118  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  40.24 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  36.07 
 
 
235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  37.3 
 
 
288 aa  114  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  37.17 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  37.77 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  37.23 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  37.29 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  33.52 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  33.52 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  37.02 
 
 
228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  35.57 
 
 
236 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  34.04 
 
 
237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  35.52 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  36.76 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  32.27 
 
 
237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  32.27 
 
 
237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  36.17 
 
 
231 aa  108  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  34.86 
 
 
243 aa  108  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 
228 aa  108  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  35.83 
 
 
228 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0634  putative glutamine amidotransferase  46.51 
 
 
184 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  35.14 
 
 
236 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  37.23 
 
 
239 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  38.07 
 
 
389 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  35.64 
 
 
229 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  35.68 
 
 
236 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  35.57 
 
 
244 aa  106  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  35.11 
 
 
222 aa  106  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  35.68 
 
 
236 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  33.48 
 
 
233 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  32.62 
 
 
236 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  30.88 
 
 
226 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  32.44 
 
 
269 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  37.36 
 
 
233 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  34.31 
 
 
236 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  34.31 
 
 
236 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  35.14 
 
 
236 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  35.2 
 
 
222 aa  102  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4150  glutamine amidotransferase  32.42 
 
 
254 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  34.05 
 
 
236 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  38.62 
 
 
233 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  33.52 
 
 
245 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  33.82 
 
 
236 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  35.43 
 
 
223 aa  99.8  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  40.4 
 
 
237 aa  99.4  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  33.78 
 
 
249 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  33.49 
 
 
248 aa  99.8  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  35.2 
 
 
209 aa  99.4  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  42.86 
 
 
232 aa  99.4  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  35 
 
 
245 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  37.16 
 
 
234 aa  99  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  36.26 
 
 
239 aa  98.6  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  33.7 
 
 
230 aa  98.2  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  37.31 
 
 
234 aa  98.2  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  31.82 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  36 
 
 
246 aa  97.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  34.21 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  34.59 
 
 
236 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  30.9 
 
 
237 aa  96.7  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  32 
 
 
244 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  34.59 
 
 
236 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  28.89 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  34.59 
 
 
236 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  34.59 
 
 
236 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  34.59 
 
 
236 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1579  glutamine amidotransferase  36.76 
 
 
242 aa  96.3  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430853  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 
261 aa  96.3  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  34.59 
 
 
236 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  31.22 
 
 
245 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  31.36 
 
 
228 aa  95.5  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  36.5 
 
 
222 aa  94.7  8e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3704  glutamine amidotransferase  32.57 
 
 
251 aa  95.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.480438  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  32.57 
 
 
251 aa  94.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  29.15 
 
 
251 aa  94.4  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  31.91 
 
 
238 aa  94.4  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  33.92 
 
 
222 aa  94  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  31.22 
 
 
245 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  34.05 
 
 
236 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  30.66 
 
 
245 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  37.11 
 
 
234 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1012  glutamine amidotransferase  33.03 
 
 
249 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  34.44 
 
 
232 aa  91.3  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0578431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>