More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0839 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 243 aa  498  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  61.34 
 
 		 250 aa  306  3e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  61.64 
 
 		 233 aa  285  5.999999999999999e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  48.72 
 
 		 243 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  49.57 
 
 		 258 aa  218  7.999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  47.41 
 
 		 237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  46.55 
 
 		 250 aa  209  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  48.5 
 
 		 247 aa  208  7e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  47.62 
 
 		 245 aa  203  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  41.99 
 
 		 241 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  42.06 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  42.27 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  43.86 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  39.83 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  41.28 
 
 		 240 aa  176  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  41.28 
 
 		 240 aa  174  9e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  35.47 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  36.52 
 
 		 240 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  36.52 
 
 		 240 aa  143  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  38.89 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  39.9 
 
 		 241 aa  134  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  36.32 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  36.05 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  34.26 
 
 		 238 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  29.08 
 
 		 258 aa  99.8  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  32.8 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  35.38 
 
 		 231 aa  99.4  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  39.87 
 
 		 228 aa  98.6  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  33.82 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  40.13 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  35.8 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  34.97 
 
 		 246 aa  95.5  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  31.43 
 
 		 241 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  36.08 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  33.18 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  34.5 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  37.69 
 
 		 240 aa  92  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  33.67 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  33.82 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  37.04 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  30.9 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  34.43 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  31.9 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  37.34 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  37.14 
 
 		 278 aa  86.7  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  31.28 
 
 		 229 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  31.95 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  35.76 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  36 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  26.09 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  34.23 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  37.14 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  32.56 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  36.2 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  31.31 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31460  GMP synthase family protein  36.87 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000828647  normal  0.202154 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  31.31 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  32.88 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  32.42 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2935  glutamine amidotransferase class-I  35.06 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  31.73 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  30.65 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03160  glutamine amidotransferase  44.66 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  30.51 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  33.54 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  27.88 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0768  glutamine amidotransferase class-I  27.64 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  28.57 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  33.76 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  35.06 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  30.69 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  27.14 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  28.03 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  33.72 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  29.28 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1289  glutamine amidotransferase  30.1 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0579596  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2609  glutamine amidotransferase class-I  41.03 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  32.97 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  29.03 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  39.42 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2980  glutamine amidotransferase  41.35 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0885879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0422  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  31.85 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  27.78 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  30.6 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  33.52 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  30.05 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  35.67 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  30.05 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  29.59 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  26.29 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  33.55 
 
 		 236 aa  72  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  37.84 
 
 		 526 aa  72  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  36.08 
 
 		 235 aa  72  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  30.97 
 
 		 228 aa  72  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  27.04 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  30.77 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  35.33 
 
 		 534 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  38.84 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>