More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0936 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  100 
 
 		 231 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  59.39 
 
 		 229 aa  274  9e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  52.84 
 
 		 232 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  47.14 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  48.48 
 
 		 228 aa  205  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  48.05 
 
 		 228 aa  201  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  47.75 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  40.74 
 
 		 236 aa  138  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  44.91 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  38.55 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  40.86 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  45.14 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  45.2 
 
 		 254 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  39.29 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  45.52 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  36.67 
 
 		 235 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  40.96 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  36.47 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0523  glutamine amidotransferase, class I  35.32 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.947174  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  43.36 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  38.38 
 
 		 282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  43.05 
 
 		 237 aa  118  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  43.05 
 
 		 237 aa  118  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  34.94 
 
 		 228 aa  119  6e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  33.84 
 
 		 229 aa  118  7e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  42.28 
 
 		 245 aa  118  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  42.95 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  36.67 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  35.26 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  34.34 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  35.64 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  37.1 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  39.49 
 
 		 261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  39.73 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  31.49 
 
 		 238 aa  111  8.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  41.04 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  37.82 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  36.78 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  38.17 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  35.53 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  37.17 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1960  glutamine amidotransferase class-I  31.2 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  36.17 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  37.5 
 
 		 227 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  32.05 
 
 		 237 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  36.21 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  36.21 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  39.31 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  34.07 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0768  glutamine amidotransferase class-I  29.31 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  30.77 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  40.82 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  40.28 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  40.88 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  32.78 
 
 		 229 aa  105  8e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  42.11 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  35.98 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  43.57 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  33.68 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  36.97 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  38.38 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  31.96 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  38.1 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  34.22 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  30.57 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  34.76 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  40.14 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3704  glutamine amidotransferase  34.22 
 
 		 251 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.480438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  37.37 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  39.35 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  35.22 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  31.28 
 
 		 233 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  41.73 
 
 		 232 aa  99.4  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  33.69 
 
 		 288 aa  99.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  33.16 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  33.16 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  41.98 
 
 		 241 aa  98.6  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  33.16 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  33.16 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  32.66 
 
 		 247 aa  98.6  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  33.16 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  41.43 
 
 		 233 aa  98.2  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  37.7 
 
 		 255 aa  98.6  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  36.75 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4150  glutamine amidotransferase  33.86 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  34.29 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  36.16 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  34.76 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  42.14 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  30.57 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0634  putative glutamine amidotransferase  39.69 
 
 		 184 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  38.62 
 
 		 264 aa  96.3  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  40.58 
 
 		 239 aa  95.9  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  33.18 
 
 		 236 aa  96.3  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  38.86 
 
 		 258 aa  95.9  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  35.64 
 
 		 249 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  34.22 
 
 		 244 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  32.63 
 
 		 236 aa  95.5  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  29.13 
 
 		 238 aa  95.5  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  32.63 
 
 		 236 aa  95.5  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>