More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0299 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 240 aa  478  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  44.73 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  37.83 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  36.67 
 
 		 243 aa  161  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  41.42 
 
 		 225 aa  158  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  41.42 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  40.59 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  33.33 
 
 		 232 aa  151  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  33.18 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  34.17 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  33.33 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  34.17 
 
 		 232 aa  148  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  36.82 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  39.24 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  35 
 
 		 242 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  37.66 
 
 		 238 aa  138  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  35.24 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  37.13 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  36.4 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  33.2 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  31.54 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  37.39 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  37.08 
 
 		 230 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  33.33 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  32.92 
 
 		 244 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  32.92 
 
 		 244 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  34.36 
 
 		 241 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  37.62 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  32.51 
 
 		 243 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  36.93 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  30.28 
 
 		 252 aa  121  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  35.02 
 
 		 244 aa  118  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  35.53 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  31.93 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  35.55 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  44.6 
 
 		 236 aa  98.2  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  38.64 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 239 aa  92  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  29.85 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  36.41 
 
 		 235 aa  85.5  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  35.4 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  34.23 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  36.3 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  33.67 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  36.42 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  34.33 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  32.02 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  34.9 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  33.53 
 
 		 228 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  32.37 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  31.41 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  38.35 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  37.41 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  36.84 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  31.61 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  35.14 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  33.5 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  32.48 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  31.38 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  26.86 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  29.33 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  33.97 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  32.84 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  31.25 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  39.2 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00680  cytoplasm protein, putative  30.72 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822893  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  33.79 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  33.79 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  38.51 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  26.67 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  27.04 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  31.65 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3185  glutamine amidotransferase class-I  35.66 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620946 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  34.5 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  26.02 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  32.37 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  38.52 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  31.12 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  35.14 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  30.08 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  28.86 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  25.51 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  31.16 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  33.5 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  35.42 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  31.94 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  35.04 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  30.46 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  35.71 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  26.83 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  34.56 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  31.25 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  30.67 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  28.05 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  37.24 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  26.85 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  28.29 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  32.28 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  28.66 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  33.1 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>