110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM00680 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006682  CNM00680  cytoplasm protein, putative  100 
 
 		 357 aa  726    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822893  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  35.98 
 
 		 252 aa  139  8.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  32.53 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  29.26 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  30.81 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  29.94 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  33.33 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  29.94 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  29.34 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  28.33 
 
 		 232 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  28.49 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  29.57 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  30.48 
 
 		 225 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  30.48 
 
 		 225 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  30.53 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  29.83 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  26.99 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  27.17 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  30.72 
 
 		 232 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  29.84 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  30.25 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  27.81 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  27.81 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  27.65 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  28.57 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  31.1 
 
 		 251 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  28.65 
 
 		 244 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  29.88 
 
 		 232 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  28.9 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  28.33 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  26.19 
 
 		 240 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  30.97 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  29.41 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47463  Predicted glutamine synthetase glutamine amidotransferase  27.94 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.881138 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  28.66 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  33.55 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  30.99 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  26.16 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  27.33 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  32.91 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  28.31 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  27.49 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  27 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34923  predicted protein  30.21 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366717  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08975  conserved hypothetical protein  23.83 
 
 		 284 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0643563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  35.63 
 
 		 235 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  26.23 
 
 		 246 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  27.8 
 
 		 237 aa  53.9  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  25.29 
 
 		 240 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  24.85 
 
 		 220 aa  53.9  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  31.65 
 
 		 228 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  25.67 
 
 		 240 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  24.84 
 
 		 278 aa  53.1  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1723  GMP synthase  23.96 
 
 		 505 aa  52.8  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.734167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  28.92 
 
 		 253 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  31.06 
 
 		 276 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  24.69 
 
 		 249 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  25.88 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  28.87 
 
 		 258 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  29.11 
 
 		 239 aa  50.8  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  25.17 
 
 		 227 aa  49.7  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  25.17 
 
 		 227 aa  49.7  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  27.78 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  25.48 
 
 		 238 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  28.21 
 
 		 235 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  26.71 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  29.46 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  27.78 
 
 		 237 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  27.78 
 
 		 237 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  23.67 
 
 		 240 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  24.61 
 
 		 246 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  24.24 
 
 		 246 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2606  glutamine amidotransferase class-I  27.13 
 
 		 280 aa  47  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  29.13 
 
 		 240 aa  46.6  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3367  GMP synthase  26.23 
 
 		 541 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  27.66 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  28.85 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  28.4 
 
 		 248 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  25 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  31.15 
 
 		 222 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  28.57 
 
 		 254 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  30.95 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  25.71 
 
 		 515 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  30.2 
 
 		 236 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1245  GMP synthase  27.17 
 
 		 539 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1867  GMP synthase  27.63 
 
 		 518 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  25 
 
 		 523 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  26.09 
 
 		 229 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  26.19 
 
 		 241 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2935  glutamine amidotransferase class-I  29.75 
 
 		 249 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  27.33 
 
 		 240 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  28.7 
 
 		 241 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0005  GMP synthase  29.41 
 
 		 518 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1635  GMP synthase  29.41 
 
 		 518 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.90601  normal  0.444029 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3485  GMP synthase  27.27 
 
 		 525 aa  44.3  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  26.24 
 
 		 250 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  25.87 
 
 		 275 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31460  GMP synthase family protein  27.44 
 
 		 248 aa  44.3  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000828647  normal  0.202154 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  24.07 
 
 		 209 aa  43.9  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  26.04 
 
 		 236 aa  43.5  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>