More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3152 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
242 aa  481  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  49.15 
 
 
261 aa  192  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  48.72 
 
 
255 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  48.47 
 
 
264 aa  175  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  46.81 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  41.67 
 
 
249 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  42.36 
 
 
233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  42.49 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  34.78 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  36.84 
 
 
241 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  39.25 
 
 
232 aa  122  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  39.78 
 
 
228 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31460  GMP synthase family protein  42.93 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000828647  normal  0.202154 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  42.13 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  38.17 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  38.17 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2935  glutamine amidotransferase class-I  43.14 
 
 
249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  37.82 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  28.76 
 
 
228 aa  109  5e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  28.76 
 
 
228 aa  108  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  36.32 
 
 
237 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  32.11 
 
 
230 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  33.18 
 
 
239 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  36.32 
 
 
237 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  37.89 
 
 
237 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  37.7 
 
 
236 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  33.18 
 
 
229 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  38.78 
 
 
243 aa  105  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4908  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  34.38 
 
 
224 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231042  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 
247 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  32.97 
 
 
229 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  39.89 
 
 
254 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  36.17 
 
 
236 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  40.88 
 
 
245 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  38.74 
 
 
249 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  37.57 
 
 
288 aa  98.6  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  30.32 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  31.38 
 
 
229 aa  97.4  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  42.57 
 
 
250 aa  95.5  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  35.64 
 
 
234 aa  95.5  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  43.75 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  35.16 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  31.45 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  31.45 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  35.48 
 
 
258 aa  93.2  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  32.97 
 
 
235 aa  92.4  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  32.56 
 
 
233 aa  92  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  29.47 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  26.63 
 
 
229 aa  90.1  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
233 aa  90.1  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  35.98 
 
 
224 aa  90.1  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  29.67 
 
 
251 aa  89.4  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  32.46 
 
 
282 aa  89  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  37.58 
 
 
237 aa  89  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  31.22 
 
 
238 aa  89  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  33.16 
 
 
238 aa  87.8  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  39.88 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  38.93 
 
 
241 aa  87.8  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  31.69 
 
 
231 aa  87.8  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  30 
 
 
218 aa  87.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  45.59 
 
 
276 aa  86.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  34.43 
 
 
243 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  31.38 
 
 
255 aa  86.3  4e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  27.62 
 
 
243 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  29.63 
 
 
236 aa  85.5  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  31.98 
 
 
245 aa  85.5  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  35.14 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  40.65 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  35.71 
 
 
947 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  32.66 
 
 
249 aa  84  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  29.67 
 
 
230 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  34.92 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  32.13 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  32.5 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  36.13 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  34.2 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  28.79 
 
 
245 aa  82  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  31.41 
 
 
242 aa  82  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  33.67 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  34.22 
 
 
389 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  30.69 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2575  glutamine amidotransferase class-I  31.84 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  32 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  36.55 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  28.65 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0829  glutamine amidotransferase class-I  39.22 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135079  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  28.79 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  35.45 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  36.63 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  34.66 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  36.84 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  33.9 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  33.33 
 
 
226 aa  79  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  31.15 
 
 
233 aa  79  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  37.5 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  31.79 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  32.28 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  28.26 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  32 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>