More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1309 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
222 aa  445  1.0000000000000001e-124  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  51.2 
 
 
209 aa  216  1e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  40.59 
 
 
220 aa  144  9e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  37.38 
 
 
229 aa  124  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  43.68 
 
 
237 aa  121  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  35.34 
 
 
237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  35.34 
 
 
237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  37.02 
 
 
227 aa  118  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  37.02 
 
 
227 aa  118  9e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  37.5 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  38.92 
 
 
236 aa  116  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  34.01 
 
 
222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  37.63 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  40.88 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  39.46 
 
 
234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  34.08 
 
 
234 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  38.17 
 
 
228 aa  112  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  38.71 
 
 
242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1954  glutamine amidotransferase class-I  34.98 
 
 
238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.370559  normal  0.016574 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  33.49 
 
 
234 aa  112  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  37.43 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  36.41 
 
 
232 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  40.53 
 
 
236 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  39.46 
 
 
234 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  40.68 
 
 
224 aa  108  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  42.18 
 
 
238 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  34.04 
 
 
235 aa  107  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  35.33 
 
 
239 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  39.08 
 
 
231 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  36.76 
 
 
239 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  35.11 
 
 
218 aa  106  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  37.5 
 
 
236 aa  105  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  39.43 
 
 
231 aa  105  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  34.18 
 
 
245 aa  104  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  35.9 
 
 
244 aa  104  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  42.47 
 
 
233 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  36.26 
 
 
233 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  35.8 
 
 
232 aa  102  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  38.1 
 
 
254 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  39.13 
 
 
235 aa  101  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  35 
 
 
228 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  42 
 
 
235 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  35.85 
 
 
229 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  35.16 
 
 
222 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  37.24 
 
 
243 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  36.02 
 
 
230 aa  99.4  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  35.84 
 
 
233 aa  99.8  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  33.83 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  37.57 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  35.87 
 
 
234 aa  99.4  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  31.96 
 
 
243 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  33.82 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  34.44 
 
 
261 aa  99.4  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  35.05 
 
 
243 aa  98.6  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  37.17 
 
 
245 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  34.44 
 
 
228 aa  99  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  33.67 
 
 
245 aa  98.6  7e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  37.24 
 
 
243 aa  98.2  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  36.46 
 
 
229 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1717  glutamine amidotransferase class-I  34.78 
 
 
237 aa  97.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  33.87 
 
 
237 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  41.5 
 
 
251 aa  95.9  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  33 
 
 
236 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  35.45 
 
 
233 aa  94  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  32.51 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  33 
 
 
236 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  33 
 
 
236 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  34.04 
 
 
229 aa  94  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  33 
 
 
236 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  33.81 
 
 
245 aa  92.8  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  31.11 
 
 
231 aa  92.4  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0829  glutamine amidotransferase class-I  30.05 
 
 
232 aa  92.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135079  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  37.01 
 
 
238 aa  92.4  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  33.98 
 
 
236 aa  92.4  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  32.8 
 
 
237 aa  92  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  32.35 
 
 
236 aa  92  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  38.19 
 
 
241 aa  92  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  34.38 
 
 
276 aa  92  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1579  glutamine amidotransferase  37.84 
 
 
242 aa  91.7  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430853  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  31.86 
 
 
236 aa  91.7  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  35.71 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  35.08 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  35.08 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  35.08 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2575  glutamine amidotransferase class-I  33.83 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  35.08 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  34.41 
 
 
237 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  35.08 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  36.62 
 
 
269 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  35.6 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  34.91 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  34.65 
 
 
255 aa  89.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  34.34 
 
 
247 aa  89.4  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  32.37 
 
 
282 aa  89.4  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0112  glutamine amidotransferase  35.09 
 
 
267 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0056  glutamine amidotransferase  34.44 
 
 
260 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  34.41 
 
 
237 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  34.55 
 
 
236 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  36.07 
 
 
238 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  34.55 
 
 
236 aa  88.6  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>