More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3715 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 234 aa  461  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  63.88 
 
 		 239 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  60.96 
 
 		 234 aa  255  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  60.53 
 
 		 234 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  58.7 
 
 		 242 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  56.47 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  54.22 
 
 		 234 aa  231  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  52.38 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  51.95 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  52.38 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  51.52 
 
 		 236 aa  225  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  51.95 
 
 		 236 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  49.36 
 
 		 237 aa  222  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  51.95 
 
 		 236 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  49.12 
 
 		 237 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  51.1 
 
 		 237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  50.22 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  50.88 
 
 		 237 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  49.78 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  49.78 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  49.78 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  49.78 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  49.78 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  49.78 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  49.78 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  52.17 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  50.22 
 
 		 241 aa  215  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  49.35 
 
 		 236 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  51.95 
 
 		 238 aa  213  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  48.68 
 
 		 234 aa  201  7e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1954  glutamine amidotransferase class-I  49.56 
 
 		 238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.370559  normal  0.016574 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  50.43 
 
 		 232 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  47.62 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  46.19 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1579  glutamine amidotransferase  45.61 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430853  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  40.43 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  36.71 
 
 		 235 aa  161  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  38.74 
 
 		 231 aa  155  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  44.74 
 
 		 238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  34.05 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  35.43 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  35.43 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  40.7 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  37.81 
 
 		 231 aa  136  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  43.16 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  34.8 
 
 		 220 aa  132  5e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  37.14 
 
 		 237 aa  132  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  47.18 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  40.68 
 
 		 235 aa  128  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  40.34 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  42.48 
 
 		 233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  42.31 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  43.04 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  36.13 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  36.22 
 
 		 229 aa  121  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  35.24 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  43.15 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  33.75 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  36.23 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  38.1 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  41.71 
 
 		 234 aa  115  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  33.05 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  33.05 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  41.1 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  38.22 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  37.43 
 
 		 233 aa  113  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  35.75 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  39.49 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0634  putative glutamine amidotransferase  46.15 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  34.92 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  40.85 
 
 		 389 aa  108  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  38.83 
 
 		 222 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  34.63 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  35.39 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  32.38 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  36.02 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  32.28 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  28.4 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  33.85 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  29.5 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  31.56 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  36.02 
 
 		 228 aa  101  8e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  39.73 
 
 		 947 aa  101  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  29 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  39.01 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  37.5 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  31.82 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  36.32 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  38.3 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  35.22 
 
 		 233 aa  99.8  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  34.9 
 
 		 261 aa  99.4  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  35.87 
 
 		 222 aa  99.4  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  35.35 
 
 		 252 aa  99  5e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  44.72 
 
 		 276 aa  99  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  37.16 
 
 		 218 aa  99  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  33.83 
 
 		 247 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  31.2 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  41.1 
 
 		 248 aa  98.2  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  31.2 
 
 		 243 aa  98.2  9e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  32.76 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>