More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2011 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 234 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  54.11 
 
 		 237 aa  247  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  55.26 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  53.3 
 
 		 237 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  55.86 
 
 		 231 aa  234  8e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  54.22 
 
 		 234 aa  231  9e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  54.67 
 
 		 236 aa  228  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  54.67 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  53.33 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  53.07 
 
 		 236 aa  225  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  53.33 
 
 		 236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  53.78 
 
 		 236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  53.98 
 
 		 239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  54.67 
 
 		 236 aa  224  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  52.86 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  51.72 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  52.89 
 
 		 236 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  52.89 
 
 		 236 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  52.89 
 
 		 236 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  52.89 
 
 		 236 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  52.89 
 
 		 236 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  53.33 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  52.89 
 
 		 236 aa  221  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  52.44 
 
 		 236 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  53.68 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  50.23 
 
 		 234 aa  207  9e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  52 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  50.22 
 
 		 239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  51.1 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  54.81 
 
 		 242 aa  198  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1954  glutamine amidotransferase class-I  50.66 
 
 		 238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.370559  normal  0.016574 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  48.72 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  50.22 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  45.78 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  47.66 
 
 		 238 aa  188  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1579  glutamine amidotransferase  49.13 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430853  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  43.29 
 
 		 232 aa  185  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  42.46 
 
 		 231 aa  155  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  39.39 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  37.88 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  33.19 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  43.75 
 
 		 236 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  36.62 
 
 		 227 aa  143  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  36.62 
 
 		 227 aa  143  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  37.44 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  37.56 
 
 		 233 aa  138  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  40.62 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  40.22 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  39.23 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  38.55 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  39.7 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  36.67 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  36.67 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  38.54 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  44.94 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  36.46 
 
 		 229 aa  122  6e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  33.49 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  36.98 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  36.76 
 
 		 244 aa  119  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  44.74 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  34.34 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  32.43 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  42.14 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  36.32 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  36.36 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  34.08 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  37.43 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  42.38 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  38.59 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  36.76 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  34.21 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  33.16 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  40.22 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  43.95 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  34.83 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  33.16 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  34.83 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  35.45 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  34.97 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  36.25 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  29.54 
 
 		 243 aa  101  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  40.14 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  36.08 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  34.65 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  37.96 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0634  putative glutamine amidotransferase  43.08 
 
 		 184 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  32.4 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  40.29 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  38.25 
 
 		 389 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  34.52 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2398  glutamine amidotransferase class-I  38.02 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  41.06 
 
 		 222 aa  95.5  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  40 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  40.82 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1717  glutamine amidotransferase class-I  39.27 
 
 		 237 aa  92  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  38.36 
 
 		 232 aa  92  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2628  glutamine amidotransferase class-I  32.92 
 
 		 252 aa  91.7  8e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  34.8 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2575  glutamine amidotransferase class-I  32.14 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  33.16 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>