More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0062 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 236 aa  474  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  98.73 
 
 		 236 aa  470  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  93.22 
 
 		 236 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  92.8 
 
 		 236 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  91.53 
 
 		 236 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  91.95 
 
 		 236 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  91.53 
 
 		 236 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  83.05 
 
 		 236 aa  407  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  82.63 
 
 		 236 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  82.63 
 
 		 236 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  82.63 
 
 		 236 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  82.63 
 
 		 236 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  82.63 
 
 		 236 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  82.63 
 
 		 236 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  81.36 
 
 		 236 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  72.22 
 
 		 237 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  73.93 
 
 		 237 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  74.36 
 
 		 237 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  54.67 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  51.52 
 
 		 234 aa  225  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  52.81 
 
 		 241 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  47.64 
 
 		 237 aa  214  9e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  50.22 
 
 		 239 aa  209  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  48.47 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  50.22 
 
 		 233 aa  198  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  48.89 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  51.32 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  51.74 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1954  glutamine amidotransferase class-I  46.55 
 
 		 238 aa  187  8e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.370559  normal  0.016574 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  47.39 
 
 		 242 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  44.78 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  44.3 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  46.52 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1579  glutamine amidotransferase  46.72 
 
 		 242 aa  174  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430853  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  41.03 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  40.89 
 
 		 235 aa  161  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  40.93 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  36.18 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  36.7 
 
 		 236 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  40.11 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  39.04 
 
 		 238 aa  135  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  37.31 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  38.67 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  38.21 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  39.57 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  42.64 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  35.34 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  43.07 
 
 		 233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  35.93 
 
 		 232 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  34.18 
 
 		 237 aa  128  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  34.18 
 
 		 237 aa  128  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  36.22 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  40.86 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  39.04 
 
 		 228 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  34.04 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  37.78 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  29.57 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  36.76 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  31.91 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  34.93 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  33.05 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  31.33 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  31.33 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  34.25 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  43.17 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0634  putative glutamine amidotransferase  43.08 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  32.64 
 
 		 244 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  28.02 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  35.75 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  40.78 
 
 		 224 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  37.78 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  30.98 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  38.83 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  35.52 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  35.68 
 
 		 218 aa  106  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  34.97 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  29.83 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  37.3 
 
 		 276 aa  99.4  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  28.4 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2673  glutamine amidotransferase  33 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  32.09 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  26.48 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  25.21 
 
 		 243 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2631  glutamine amidotransferase  32.51 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0063485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  32.51 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2582  glutamine amidotransferase  32.51 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 229 aa  95.5  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  26.73 
 
 		 245 aa  95.5  7e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  27.92 
 
 		 237 aa  95.1  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2803  glutamine amidotransferase  32.02 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  28.51 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  33.81 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  31.65 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  28.57 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  38.13 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  32.43 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  28.51 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6109  glutamine amidotransferase  34.27 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  38.07 
 
 		 288 aa  92.4  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  32.35 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>