More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_19600 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  100 
 
 		 249 aa  495  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  41.42 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  37.5 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  36.71 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  34.02 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  36.07 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  32.48 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  37.62 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  36.65 
 
 		 237 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  36.65 
 
 		 237 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  38.74 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  38.66 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  42.76 
 
 		 242 aa  95.5  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2935  glutamine amidotransferase class-I  35.09 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  33.85 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  31.15 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  35.91 
 
 		 253 aa  92.4  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  34.36 
 
 		 222 aa  92.8  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  33.51 
 
 		 229 aa  92  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  32.23 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  39.9 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  36.65 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  36.36 
 
 		 288 aa  89.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  40 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  34.63 
 
 		 232 aa  89.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  35.23 
 
 		 247 aa  89  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  36.13 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  37.89 
 
 		 237 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  33.13 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  33.64 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  33.73 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  30.73 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  36.79 
 
 		 239 aa  87  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  34.16 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  40.41 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  34 
 
 		 245 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  38.41 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  37 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  32.11 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  34.02 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  42.5 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  39.24 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  39.24 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  39.24 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31460  GMP synthase family protein  33.33 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000828647  normal  0.202154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  35.44 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  37.57 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  34.81 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  35.26 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  35.93 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  36.63 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  32.93 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  32.41 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  36.63 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  38.61 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  32.35 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  36.87 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  38.62 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  38.85 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  35.04 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  38.85 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  38.85 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  35.19 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  37.86 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  38.85 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  38.85 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  38.85 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  32.77 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  37.5 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  38.22 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  35.18 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  34.57 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  37.58 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  38.89 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  29.96 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  31.47 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  28.88 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  34.3 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  30.72 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  33.8 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  26.42 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  28.05 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  27.8 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  29.74 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  32.65 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  31.09 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  34.69 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  36.67 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  35.09 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  32.04 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  30.16 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  30.53 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  35.26 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  30.47 
 
 		 269 aa  72  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  31.47 
 
 		 947 aa  72  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  31.52 
 
 		 246 aa  72  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  32.32 
 
 		 264 aa  72  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  26.67 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>