More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4515 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
245 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  87.35 
 
 
245 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  51.72 
 
 
232 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  39.89 
 
 
237 aa  137  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  34.8 
 
 
947 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  36.13 
 
 
239 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  36.45 
 
 
236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  42.21 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  37.44 
 
 
239 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  39.67 
 
 
231 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  37.3 
 
 
236 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  37.84 
 
 
236 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  37.84 
 
 
236 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  37.24 
 
 
227 aa  122  7e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  37.84 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  38.89 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  38.92 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  37.31 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  38.92 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  38.92 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  38.92 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  37.84 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  37.97 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  37.63 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  38.92 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  36.56 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  42.86 
 
 
246 aa  119  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  38.38 
 
 
236 aa  118  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  37.3 
 
 
236 aa  118  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  34.72 
 
 
238 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  42.19 
 
 
235 aa  118  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  37.84 
 
 
237 aa  118  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  36.76 
 
 
236 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  42.95 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  38.38 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  36.96 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  36.17 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  35.68 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  31.75 
 
 
243 aa  115  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  37.84 
 
 
236 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  40 
 
 
233 aa  115  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  36.22 
 
 
236 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  37.93 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  36.22 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  35.23 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  33.7 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  31.35 
 
 
231 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  33.19 
 
 
234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  31.72 
 
 
228 aa  112  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  38.22 
 
 
232 aa  111  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  31.52 
 
 
229 aa  111  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  31.62 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  31.62 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  37.7 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  29.36 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  38.83 
 
 
228 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  31.28 
 
 
235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  31.75 
 
 
229 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  34.26 
 
 
234 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  28.77 
 
 
229 aa  107  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  37.36 
 
 
234 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  36.78 
 
 
234 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  42.86 
 
 
242 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  33.04 
 
 
234 aa  104  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  34.84 
 
 
232 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  35.52 
 
 
239 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  36.75 
 
 
235 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  36.21 
 
 
241 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  33.51 
 
 
233 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  38.95 
 
 
246 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  37.89 
 
 
261 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  29.86 
 
 
227 aa  102  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  29.86 
 
 
227 aa  102  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  36.61 
 
 
233 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1954  glutamine amidotransferase class-I  40.62 
 
 
238 aa  101  9e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.370559  normal  0.016574 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  37.31 
 
 
249 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  30.85 
 
 
220 aa  101  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  32.84 
 
 
245 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  30.61 
 
 
229 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  38.31 
 
 
245 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  33.53 
 
 
218 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  36.97 
 
 
238 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  37.44 
 
 
389 aa  97.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1960  glutamine amidotransferase class-I  32.31 
 
 
237 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  31.82 
 
 
209 aa  97.8  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  35.27 
 
 
261 aa  95.5  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  34.57 
 
 
288 aa  95.5  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  36.46 
 
 
255 aa  95.1  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  31.89 
 
 
226 aa  95.1  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  32.48 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  32.07 
 
 
222 aa  93.6  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  29.41 
 
 
233 aa  93.2  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  32.75 
 
 
231 aa  93.2  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  30.98 
 
 
223 aa  92  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  32.46 
 
 
247 aa  92  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2582  glutamine amidotransferase  34.22 
 
 
239 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  35.42 
 
 
264 aa  90.9  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  34.22 
 
 
239 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2631  glutamine amidotransferase  34.22 
 
 
239 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0063485  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>