More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0502 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 246 aa  507  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1245  molybdopterin oxidoreductase  35.63 
 
 		 947 aa  132  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00127782 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  36.4 
 
 		 237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  43.04 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  39.66 
 
 		 238 aa  125  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  43.51 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  40.43 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  39.68 
 
 		 234 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  38.34 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  37 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  38.02 
 
 		 234 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  42.86 
 
 		 245 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  42.57 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  33.2 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  39.64 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  42.03 
 
 		 233 aa  115  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  37.25 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  42.14 
 
 		 234 aa  115  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  40.97 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  39.02 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  36.41 
 
 		 236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  37.43 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  34.73 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  38.12 
 
 		 229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  38.07 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  37.1 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  37.22 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  37.78 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  42.17 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  37.14 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  41.78 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  37.14 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  42.76 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  38.67 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  41.61 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  39.72 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  36.56 
 
 		 236 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  33.11 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  36.56 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  35.2 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  36.56 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  36.42 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  46.04 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  36.56 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  36.56 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  36.56 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  39.31 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  37.22 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  32.95 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  33.11 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  41.46 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  38.12 
 
 		 236 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  38.26 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  33 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  38.3 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  31.46 
 
 		 229 aa  105  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  34.76 
 
 		 237 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  30.9 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  33.11 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  31.34 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  32.83 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  31.34 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  37.74 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  35.75 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  37.27 
 
 		 238 aa  99  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  34.04 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  36.27 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  38.57 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  34.81 
 
 		 228 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  34.15 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  36 
 
 		 218 aa  97.4  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  39.13 
 
 		 235 aa  97.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  36.88 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  32.52 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  31.21 
 
 		 251 aa  96.3  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3004  glutamine amidotransferase class-I  33.97 
 
 		 232 aa  96.3  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  40.28 
 
 		 233 aa  95.9  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2575  glutamine amidotransferase class-I  32.7 
 
 		 213 aa  95.5  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  37.43 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  38.69 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  33.7 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  32.14 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3054  glutamine amidotransferase  33.74 
 
 		 231 aa  94.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  35.22 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  31.56 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  32.53 
 
 		 227 aa  93.6  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  33.5 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1579  glutamine amidotransferase  42.18 
 
 		 242 aa  92.8  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430853  normal  0.871002 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2628  glutamine amidotransferase class-I  32.65 
 
 		 209 aa  92.4  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  34.69 
 
 		 247 aa  92.4  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  32.26 
 
 		 232 aa  92  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  31.14 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  32.5 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1954  glutamine amidotransferase class-I  37.68 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.370559  normal  0.016574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  38.51 
 
 		 224 aa  89.4  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0511  glutamine amidotransferase class-I  31.9 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0538206  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  28.83 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12401  hypothetical protein  31.29 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>