259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0770 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  100 
 
 
231 aa  465  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  42.86 
 
 
232 aa  197  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  43.72 
 
 
232 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  40.26 
 
 
232 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  39.83 
 
 
234 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  40.69 
 
 
244 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  40.69 
 
 
244 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  40.69 
 
 
244 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  40.25 
 
 
243 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  38.56 
 
 
240 aa  179  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  45.65 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  43.97 
 
 
251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  39.15 
 
 
242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  38.98 
 
 
240 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  44.78 
 
 
230 aa  171  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  35.5 
 
 
232 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  38.98 
 
 
240 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  37.71 
 
 
242 aa  168  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  42.92 
 
 
231 aa  165  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  43.78 
 
 
233 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  37.02 
 
 
241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  37.99 
 
 
237 aa  158  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  40.09 
 
 
238 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  39.81 
 
 
233 aa  148  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  33.19 
 
 
243 aa  144  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  37.39 
 
 
226 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  38.36 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  38.36 
 
 
225 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  38.36 
 
 
225 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  34.33 
 
 
236 aa  131  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.307649 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  31.51 
 
 
240 aa  111  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  34.52 
 
 
236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  36.26 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  33.85 
 
 
243 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  34.36 
 
 
239 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  30.88 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  33.15 
 
 
249 aa  95.1  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  32.09 
 
 
238 aa  94.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  30.24 
 
 
239 aa  94  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  32.77 
 
 
246 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  31.67 
 
 
258 aa  88.6  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  27.83 
 
 
252 aa  87  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  31.89 
 
 
258 aa  87  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  32.61 
 
 
250 aa  86.3  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  32.12 
 
 
278 aa  84  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  30.9 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  32.06 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  34 
 
 
235 aa  81.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  32.65 
 
 
237 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  29.33 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  30.33 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  31.56 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  28.1 
 
 
240 aa  77  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  31.36 
 
 
240 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  29.28 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00680  cytoplasm protein, putative  26.99 
 
 
357 aa  75.5  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822893  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  27.51 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  32.64 
 
 
246 aa  72  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34923  predicted protein  29.85 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366717  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  23.33 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  26.37 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  31.74 
 
 
240 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47463  Predicted glutamine synthetase glutamine amidotransferase  27.42 
 
 
301 aa  67  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.881138 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  26.73 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  31.97 
 
 
240 aa  63.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  32.45 
 
 
236 aa  62.8  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  31.97 
 
 
240 aa  62.4  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  30.26 
 
 
230 aa  62.4  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  28.41 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  28.76 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  26.32 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  27.54 
 
 
241 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3848  glutamine amidotransferase class-I  47.62 
 
 
213 aa  59.7  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  33.11 
 
 
253 aa  59.3  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  27.92 
 
 
236 aa  59.3  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  27.84 
 
 
249 aa  58.9  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2398  glutamine amidotransferase class-I  32.85 
 
 
257 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  29.45 
 
 
238 aa  57  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  28.82 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3627  glutamine amidotransferase class-I  42.11 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  28.36 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  28.4 
 
 
228 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  27.38 
 
 
507 aa  57  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  29.53 
 
 
238 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  29.82 
 
 
228 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  28 
 
 
251 aa  55.8  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  26.97 
 
 
249 aa  55.1  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  24.85 
 
 
228 aa  55.1  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  29.12 
 
 
255 aa  55.1  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  27.63 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  30.94 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  27.63 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  27.7 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0634  putative glutamine amidotransferase  31.85 
 
 
184 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1289  glutamine amidotransferase  25.6 
 
 
246 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0579596  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  23.46 
 
 
229 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  27.49 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  30.86 
 
 
276 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>