244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0634 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0634  putative glutamine amidotransferase  100 
 
 
184 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0652116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06930  putative glutamine amidotransferase  92.39 
 
 
238 aa  342  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  50.56 
 
 
236 aa  169  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1536  amidotransferase  46.82 
 
 
226 aa  155  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.03315  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  43.86 
 
 
229 aa  154  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  43.75 
 
 
231 aa  151  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  43.43 
 
 
235 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  39.31 
 
 
233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  43.5 
 
 
230 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1005  glutamine amidotransferase class-I  44.92 
 
 
244 aa  142  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  38.95 
 
 
231 aa  142  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  46.79 
 
 
237 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  46.79 
 
 
237 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  43.43 
 
 
229 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2989  hypothetical protein  45.52 
 
 
229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.721184  normal  0.0157229 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  37.57 
 
 
243 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  34.46 
 
 
251 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  40.7 
 
 
233 aa  128  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  39.24 
 
 
237 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  41.38 
 
 
220 aa  120  9e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  42.37 
 
 
234 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  43.7 
 
 
236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  43.7 
 
 
236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  43.08 
 
 
236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  43.7 
 
 
236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  43.08 
 
 
236 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  42.22 
 
 
236 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  45.83 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  41.13 
 
 
236 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  42.96 
 
 
236 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  40.62 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  35.12 
 
 
228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  33.53 
 
 
230 aa  111  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  43.61 
 
 
237 aa  111  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  51.16 
 
 
233 aa  111  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  34.52 
 
 
228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  46.15 
 
 
234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  43.85 
 
 
237 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  36.72 
 
 
223 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  40.97 
 
 
237 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  46.51 
 
 
218 aa  107  8.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  47.76 
 
 
236 aa  107  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  44.29 
 
 
232 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  40.77 
 
 
236 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  38.3 
 
 
227 aa  105  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  38.3 
 
 
227 aa  105  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0513  glutamine amidotransferase class-I  39.18 
 
 
234 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0638034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  43.57 
 
 
228 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0473  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  34.13 
 
 
222 aa  105  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000577087  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  40.77 
 
 
236 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  40.77 
 
 
236 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  40.77 
 
 
236 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  40.77 
 
 
236 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  40.77 
 
 
236 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  40.77 
 
 
236 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  31.46 
 
 
229 aa  102  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2575  glutamine amidotransferase class-I  40.8 
 
 
213 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  41.6 
 
 
238 aa  102  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  40 
 
 
236 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  43.08 
 
 
234 aa  101  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1302  glutamine amidotransferase  44.27 
 
 
232 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  46.34 
 
 
222 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1158  glutamine amidotransferase  42.96 
 
 
242 aa  99  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33160  Glutamine amidotransferase class-I protein  43.08 
 
 
235 aa  99  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0923229  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  43.61 
 
 
234 aa  98.6  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  37.78 
 
 
227 aa  97.1  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  43.51 
 
 
224 aa  97.1  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  39.69 
 
 
231 aa  96.7  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3512  glutamine amidotransferase  43.08 
 
 
241 aa  96.3  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  42.86 
 
 
234 aa  95.9  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1954  glutamine amidotransferase class-I  36.88 
 
 
238 aa  95.9  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.370559  normal  0.016574 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  36.92 
 
 
237 aa  94.4  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  41.67 
 
 
236 aa  94.4  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  41.98 
 
 
232 aa  94  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6109  glutamine amidotransferase  36.69 
 
 
240 aa  92  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2384  glutamine amidotransferase class-I  42.31 
 
 
233 aa  90.5  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  32.89 
 
 
235 aa  88.6  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1435  glutamine amidotransferase class-I  41.13 
 
 
231 aa  88.6  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.75967  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  39.86 
 
 
241 aa  87.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2673  glutamine amidotransferase  36.69 
 
 
239 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2697  glutamine amidotransferase  36.69 
 
 
239 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.215573  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  36.88 
 
 
245 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2713  glutamine amidotransferase  31.06 
 
 
241 aa  86.7  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2631  glutamine amidotransferase  32.39 
 
 
239 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0063485  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2582  glutamine amidotransferase  35.97 
 
 
239 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  36.17 
 
 
245 aa  85.5  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2565  glutamine amidotransferase class-I  37.34 
 
 
238 aa  84.7  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  41.22 
 
 
245 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1047  GMP synthase  33.7 
 
 
222 aa  85.1  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  36.93 
 
 
288 aa  84.7  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2803  glutamine amidotransferase  35.25 
 
 
239 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0502  glutamine amidotransferase class-I  36.15 
 
 
246 aa  84.3  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  42.31 
 
 
254 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4214  glutamine amidotransferase  29.45 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278908  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5145  glutamine amidotransferase class-I  35.2 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1238  glutamine amidotransferase  38.21 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0578431 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1579  glutamine amidotransferase  40 
 
 
242 aa  82  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430853  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  37.78 
 
 
237 aa  82  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  33.73 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  35.61 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>