85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_47463 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_47463  Predicted glutamine synthetase glutamine amidotransferase  100 
 
 		 301 aa  617  1e-176  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.881138 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  28.25 
 
 		 252 aa  92.8  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2694  amidotransferase  28.78 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  32.95 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1420  amidotransferase  29.33 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0865  glutamine amidotransferase class-I  26.67 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3868  amidotransferase  29.67 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1842  amidotransferase  29.67 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1451  amidotransferase  29.19 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1741  amidotransferase  30.09 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  27.42 
 
 		 231 aa  67  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0888  glutamine amidotransferase class-I  28.71 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02111  conserved hypothetical protein  28.2 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.974841  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00680  cytoplasm protein, putative  29.17 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.822893  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  32.74 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3519  glutamine amidotransferase class-I  29.49 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.307649 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08975  conserved hypothetical protein  24.57 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0643563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4674  amidotransferase, putative  27.97 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.623837 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2063  hypothetical protein  28.57 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0215338  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1873  amidotransferase  28.57 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  26.57 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2587  amidotransferase  28.97 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0493752 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  26.76 
 
 		 232 aa  57  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  28.49 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  25.69 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3566  amidotransferase  28.64 
 
 		 240 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1837  glutamine amidotransferase, class I  28.49 
 
 		 226 aa  54.7  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0599314  normal  0.354168 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  29.21 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  28.18 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  30.11 
 
 		 240 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  29.88 
 
 		 232 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  29.34 
 
 		 225 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42010  amidotransferase  27.57 
 
 		 240 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0696  glutamine amidotransferase class-I  22.62 
 
 		 231 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1126  glutamine amidotransferase, class I  30.97 
 
 		 237 aa  53.9  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.527906  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  29.34 
 
 		 225 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1396  glutamine amidotransferase class-I  27.06 
 
 		 238 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  26.95 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  29.55 
 
 		 240 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  33.04 
 
 		 233 aa  50.8  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  27.81 
 
 		 232 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  28.07 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  31.93 
 
 		 237 aa  49.7  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2225  putative glutamine amidotransferase class-I  30.77 
 
 		 236 aa  49.7  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.987752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  24.76 
 
 		 235 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 250 aa  49.3  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2764  GMP synthase  29.31 
 
 		 539 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.727544  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0692  glutamine amidotransferase class-I  26.4 
 
 		 230 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal  0.956702 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  25.44 
 
 		 241 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34923  predicted protein  28.14 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  26.35 
 
 		 512 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  29.41 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  27.17 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  24.11 
 
 		 251 aa  46.6  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  36.49 
 
 		 243 aa  46.6  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3013  GMP synthase  27.12 
 
 		 540 aa  46.6  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  26.78 
 
 		 230 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.31334 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  35.53 
 
 		 250 aa  46.2  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  23.68 
 
 		 243 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1245  GMP synthase  28.07 
 
 		 539 aa  46.2  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  30.48 
 
 		 240 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  29.91 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  37.35 
 
 		 236 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3367  GMP synthase  28.25 
 
 		 541 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2000  GMP synthase  26.63 
 
 		 540 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.388201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0734  glutamine amidotransferase class-I  26.4 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  25.88 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  27.53 
 
 		 510 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  28.03 
 
 		 542 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2441  GMP synthase  25.44 
 
 		 539 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  31.03 
 
 		 238 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3722  glutamine amidotransferase class-I  37.84 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.508189 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  28.7 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  27.08 
 
 		 258 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  24.48 
 
 		 229 aa  43.5  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2547  GMP synthase  28.82 
 
 		 538 aa  43.9  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72593  hitchhiker  0.00733595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  29.33 
 
 		 228 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3848  glutamine amidotransferase class-I  27.16 
 
 		 213 aa  43.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  29.52 
 
 		 240 aa  43.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1261  GMP synthase  28.82 
 
 		 538 aa  43.1  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  37.04 
 
 		 250 aa  43.1  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2398  glutamine amidotransferase class-I  32.39 
 
 		 257 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  29.27 
 
 		 247 aa  42.7  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1422  GMP synthase  28.67 
 
 		 535 aa  42.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  32.2 
 
 		 235 aa  42.4  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>