More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1270 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1270  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 243 aa  491  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17353  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1315  glutamine amidotransferase  75.21 
 
 		 243 aa  350  1e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000170552 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3327  glutamine amidotransferase  61.73 
 
 		 250 aa  311  5.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1800  glutamine amidotransferase  61.83 
 
 		 242 aa  306  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  54.73 
 
 		 260 aa  275  6e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0014  glutamine amidotransferase  57.61 
 
 		 244 aa  271  7e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2980  glutamine amidotransferase  55.42 
 
 		 260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0885879  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2609  glutamine amidotransferase class-I  56.02 
 
 		 264 aa  265  5e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  55.23 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3824  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  52.3 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.14887  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4570  glutamine amidotransferase  54.32 
 
 		 243 aa  241  7e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30350  glutamine amidotransferase  50.2 
 
 		 245 aa  239  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14740  glutamine amidotransferase  51.04 
 
 		 242 aa  235  6e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.216669 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1289  glutamine amidotransferase  47.95 
 
 		 246 aa  214  9e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0579596  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  47.11 
 
 		 243 aa  205  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03160  glutamine amidotransferase  47.97 
 
 		 264 aa  201  7e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  30.54 
 
 		 246 aa  85.1  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  41.89 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  30.39 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  47.79 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  31.15 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  34.19 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  38.73 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  37.5 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  34.72 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  35.33 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  34.09 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  36.18 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  35.14 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  32.08 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  28.92 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  31.9 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  29.75 
 
 		 241 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  26.67 
 
 		 236 aa  72  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  31.65 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  33.5 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  32.08 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  28.89 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  37.62 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  34.45 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  32.79 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  32.4 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  31.68 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  32.19 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  32.65 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  33.13 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  27.78 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1717  glutamine amidotransferase class-I  35.42 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  29.61 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2377  GMP synthase  29.25 
 
 		 509 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  30.92 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  35.62 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  32.74 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  38.24 
 
 		 515 aa  62.8  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  25.68 
 
 		 507 aa  63.2  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0589  GMP synthase  31.14 
 
 		 506 aa  62.8  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  33.87 
 
 		 533 aa  62  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  32.34 
 
 		 246 aa  62  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  26.96 
 
 		 243 aa  62  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  27.38 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  25.45 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  33.11 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  32.28 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  27.4 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4515  glutamine amidotransferase class-I  34.59 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.201421  normal  0.0267832 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0736  GMP synthase subunit A  35 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.683361  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  32.28 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  29.72 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  32.48 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  30.49 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  25.81 
 
 		 525 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  25.81 
 
 		 525 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  25.81 
 
 		 525 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  25.81 
 
 		 525 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  28.97 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4275  glutamine amidotransferase class-I  31.64 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  25.81 
 
 		 525 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  30.19 
 
 		 510 aa  58.9  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  36 
 
 		 516 aa  58.9  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  30.84 
 
 		 512 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  27.72 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  25.27 
 
 		 525 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  25.27 
 
 		 525 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  25.27 
 
 		 525 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  25.27 
 
 		 525 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  32.48 
 
 		 276 aa  58.5  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  25.27 
 
 		 525 aa  58.5  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  25.27 
 
 		 525 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  32.47 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  24.73 
 
 		 525 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  24.73 
 
 		 525 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  30.84 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  31.3 
 
 		 528 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0768  glutamine amidotransferase class-I  29.7 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  26.63 
 
 		 525 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  29.25 
 
 		 510 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  30.3 
 
 		 516 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  29.08 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  24.73 
 
 		 525 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.09 
 
 		 526 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>