More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1800 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1800  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 242 aa  479  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3327  glutamine amidotransferase  65.56 
 
 		 250 aa  315  4e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1270  glutamine amidotransferase  61.83 
 
 		 243 aa  306  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17353  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  63.07 
 
 		 260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1315  glutamine amidotransferase  65.56 
 
 		 243 aa  300  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000170552 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2609  glutamine amidotransferase class-I  63.9 
 
 		 264 aa  290  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0014  glutamine amidotransferase  63.87 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2980  glutamine amidotransferase  59.83 
 
 		 260 aa  277  9e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0885879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3824  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  58.82 
 
 		 244 aa  275  5e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.14887  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  59.41 
 
 		 247 aa  272  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4570  glutamine amidotransferase  58.51 
 
 		 243 aa  261  4.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1289  glutamine amidotransferase  55.14 
 
 		 246 aa  251  9.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0579596  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30350  glutamine amidotransferase  52.05 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14740  glutamine amidotransferase  50.83 
 
 		 242 aa  239  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.216669 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03160  glutamine amidotransferase  52.59 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  48.76 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  38.82 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  35.59 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 		 247 aa  85.9  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  33.17 
 
 		 241 aa  85.1  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  32.52 
 
 		 241 aa  85.1  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  30.65 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  40.14 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  40.87 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  34.34 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  36.42 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  34.94 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  40 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  29.2 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  28.35 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  35.45 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  37.27 
 
 		 276 aa  72  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  34.86 
 
 		 230 aa  72  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  31.13 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  27.14 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  42.37 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  34.65 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  32.18 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  28.02 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  36.31 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  38.83 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  33.72 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  41.59 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  30.36 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  30.43 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  33.91 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  32.08 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  32.78 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  37.5 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  35.43 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  35.1 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4275  glutamine amidotransferase class-I  31.79 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  28.51 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  29.6 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  32.39 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  38.39 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  30.05 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  30.3 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  29.34 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  30.54 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  32.74 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6777  glutamine amidotransferase class-I  31.32 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.430995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  31.14 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  29.92 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4193  GMP synthase  30.28 
 
 		 525 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  31.1 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  32.52 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  35.71 
 
 		 241 aa  62  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2606  glutamine amidotransferase class-I  29.95 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  30.34 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2079  glutamine amidotransferase  27.57 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  29.13 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  25.25 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  37.21 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  33.88 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  29.41 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  30.71 
 
 		 513 aa  59.7  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  34.65 
 
 		 516 aa  58.9  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  31.41 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  34 
 
 		 520 aa  58.5  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  31.61 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  31.13 
 
 		 510 aa  58.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0056  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4025  glutamine amidotransferase  30.25 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.54233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  33 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  36.79 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1030  GMP synthase  29.94 
 
 		 525 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0165  glutamine amidotransferase class-I  33.13 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  30.37 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  26.17 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  36.52 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  33.04 
 
 		 258 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  23.33 
 
 		 507 aa  57  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  30.06 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  31.78 
 
 		 529 aa  56.6  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  32.2 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  28.57 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  28.95 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  30.63 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>