More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0165 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0165  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 286 aa  570  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4275  glutamine amidotransferase class-I  75.87 
 
 		 308 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6777  glutamine amidotransferase class-I  51.61 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.430995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  47.1 
 
 		 276 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3437  glutamine amidotransferase class-I  46.07 
 
 		 305 aa  232  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3746  glutamine amidotransferase class-I  45.36 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5032  glutamine amidotransferase class-I  46.91 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3633  glutamine amidotransferase class-I  45 
 
 		 293 aa  223  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125092  normal  0.0172183 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2606  glutamine amidotransferase class-I  38.13 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  34.38 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  36.11 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  30.14 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  26.18 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  37.24 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  29.76 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  31.47 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  30.23 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  30.39 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  32.08 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  30.23 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  32.88 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  31.13 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1039  glutamine amidotransferase class-I  27.95 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  33.13 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  28.39 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  33.97 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  34.59 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  31.33 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  33.71 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  33.11 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  30.29 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  30.94 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  33.58 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  31.79 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  28.74 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  35.53 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  32.93 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  34.06 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1840  glutamine amidotransferase  31.87 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  31.11 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  31.1 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  25.37 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2622  GMP synthase  30 
 
 		 521 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  34.71 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  32.43 
 
 		 526 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  32.52 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1800  glutamine amidotransferase  33.13 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  30.19 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  30.6 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2203  hypothetical protein  25.85 
 
 		 232 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  30.51 
 
 		 520 aa  57  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0596  glutamine amidotransferase class-I  30.23 
 
 		 233 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3327  glutamine amidotransferase  31.33 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  29.09 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  34.33 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  34.51 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  33.78 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  34.21 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  33.89 
 
 		 518 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  33.89 
 
 		 518 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  28.99 
 
 		 522 aa  55.8  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  32.78 
 
 		 518 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1094  glutamine amidotransferase  34.3 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.82743 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0650  GMP synthase  26.56 
 
 		 526 aa  55.1  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.331124  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  29.88 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3631  GMP synthase  35.71 
 
 		 527 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  28.21 
 
 		 235 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  30.71 
 
 		 513 aa  54.7  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  28.77 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  29.94 
 
 		 513 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  29.94 
 
 		 513 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  25.56 
 
 		 231 aa  53.5  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  29.56 
 
 		 240 aa  53.5  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0829  glutamine amidotransferase class-I  28.28 
 
 		 232 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135079  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  29.07 
 
 		 237 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1245  GMP synthase  29.83 
 
 		 539 aa  53.5  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  29.07 
 
 		 237 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  29.56 
 
 		 242 aa  52.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  31.21 
 
 		 528 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  34.21 
 
 		 232 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  28.57 
 
 		 243 aa  53.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  30.49 
 
 		 231 aa  52.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2179  peptidase C26  25.88 
 
 		 257 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  28.06 
 
 		 509 aa  52.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  29.53 
 
 		 513 aa  52.4  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0175  peptidase C26  28.37 
 
 		 249 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000212098 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0371  GMP synthase  30.66 
 
 		 522 aa  52.4  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  26.63 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  26.69 
 
 		 513 aa  52  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3558  peptidase C26  25.88 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  30.14 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  29.73 
 
 		 515 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  31.68 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1123  GMP synthase  30.38 
 
 		 517 aa  51.6  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5207  peptidase C26  26.24 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0166  GMP synthase subunit A  27.78 
 
 		 181 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2000  GMP synthase  27.93 
 
 		 540 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.388201 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0736  GMP synthase subunit A  32.38 
 
 		 184 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.683361  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5346  peptidase C26  26.7 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>