More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3633 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3633  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 293 aa  570  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125092  normal  0.0172183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3437  glutamine amidotransferase class-I  88.46 
 
 		 305 aa  488  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3746  glutamine amidotransferase class-I  87.76 
 
 		 286 aa  486  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5032  glutamine amidotransferase class-I  63.18 
 
 		 282 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6777  glutamine amidotransferase class-I  58.72 
 
 		 284 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.430995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4275  glutamine amidotransferase class-I  45.2 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  45.82 
 
 		 276 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0165  glutamine amidotransferase class-I  45 
 
 		 286 aa  223  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2606  glutamine amidotransferase class-I  41.16 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  32.4 
 
 		 244 aa  87  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  32.97 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  34.38 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  38.89 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  37.41 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  35.76 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  32.2 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  35.04 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  31.61 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  34.31 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  29.41 
 
 		 241 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  32.91 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  29.67 
 
 		 529 aa  67  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  34.75 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  28.93 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  33.55 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.6 
 
 		 536 aa  64.7  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0538351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  32.47 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  38.05 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  32.47 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  27.46 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  31.09 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6529  GMP synthase  33.92 
 
 		 519 aa  63.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413067  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  29.87 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  34.03 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  35.9 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  25.57 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  31.1 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  31.85 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  33.55 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  33.57 
 
 		 522 aa  58.9  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  36.02 
 
 		 520 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  30.88 
 
 		 513 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10270  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.76 
 
 		 530 aa  58.5  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.38684 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  30.88 
 
 		 513 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  29.22 
 
 		 247 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0942  GMP synthase, large subunit  33.73 
 
 		 535 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00705801  normal  0.0196156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  34.12 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  33.33 
 
 		 506 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08800  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.54 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  34.18 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  30.07 
 
 		 513 aa  57  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2609  glutamine amidotransferase class-I  34.41 
 
 		 264 aa  57  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  31.25 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  30.14 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  36.17 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0589  GMP synthase  28.64 
 
 		 506 aa  55.5  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  31.82 
 
 		 513 aa  55.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  38.97 
 
 		 527 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  35.46 
 
 		 520 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  34.51 
 
 		 245 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  35.77 
 
 		 533 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0610  GMP synthase  34.27 
 
 		 528 aa  55.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.558276  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  33.73 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00200  conserved hypothetical protein  29.95 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.45844 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  29.5 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2175  hypothetical protein  24.71 
 
 		 232 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1118  anthranilate synthase component II  27.81 
 
 		 196 aa  54.7  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  28.21 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3761  para-aminobenzoate synthase  28.38 
 
 		 703 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0331515  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  29.41 
 
 		 513 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  33.33 
 
 		 261 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  34.27 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1183  GMP synthase C terminal domain protein  36.11 
 
 		 523 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.853141 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  26.21 
 
 		 189 aa  53.9  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16470  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.04 
 
 		 539 aa  53.9  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.68109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  36.61 
 
 		 516 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  27.42 
 
 		 514 aa  53.5  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  30.56 
 
 		 526 aa  53.5  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0371  GMP synthase  34.69 
 
 		 522 aa  53.5  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  31.88 
 
 		 510 aa  53.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4570  glutamine amidotransferase  35.62 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39720  GMP synthase  35.04 
 
 		 526 aa  53.1  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0705  GMP synthase, large subunit  32.77 
 
 		 524 aa  53.1  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  28.99 
 
 		 513 aa  53.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1036  GMP synthase  31.21 
 
 		 523 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.86774  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  29.45 
 
 		 288 aa  53.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  32.68 
 
 		 247 aa  53.1  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  33.09 
 
 		 246 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  39.45 
 
 		 517 aa  52.8  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1173  GMP synthase  37.78 
 
 		 519 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.868415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1190  GMP synthase  37.78 
 
 		 519 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1516  GMP synthase  37.31 
 
 		 522 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1200  GMP synthase  37.78 
 
 		 519 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  26.9 
 
 		 189 aa  52.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2974  glutamine amidotransferase  30.05 
 
 		 235 aa  52.8  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  27.53 
 
 		 243 aa  52.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2000  GMP synthase  29.45 
 
 		 540 aa  52.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.388201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>