More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3327 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3327  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 250 aa  503  1e-141  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1800  glutamine amidotransferase  65.56 
 
 		 242 aa  315  5e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1270  glutamine amidotransferase  61.73 
 
 		 243 aa  311  5.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17353  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  62.14 
 
 		 260 aa  298  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1315  glutamine amidotransferase  61 
 
 		 243 aa  288  6e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000170552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0014  glutamine amidotransferase  60.91 
 
 		 244 aa  279  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  56.49 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3824  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  56.07 
 
 		 244 aa  270  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.14887  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2980  glutamine amidotransferase  55.42 
 
 		 260 aa  269  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0885879  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2609  glutamine amidotransferase class-I  56.56 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4570  glutamine amidotransferase  58.85 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14740  glutamine amidotransferase  52.28 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.216669 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30350  glutamine amidotransferase  52.24 
 
 		 245 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03160  glutamine amidotransferase  54.07 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1289  glutamine amidotransferase  50.62 
 
 		 246 aa  227  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0579596  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  50.41 
 
 		 243 aa  214  9e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  34.45 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  34.19 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  31.77 
 
 		 247 aa  85.9  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  35.26 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  27.82 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  31.09 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  37.58 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  32.32 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  35.92 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  38.51 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  36.59 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  39.31 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  35.9 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  35.93 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  26.95 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  31.5 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  33.77 
 
 		 235 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  33.77 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  37.14 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  33.77 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2079  glutamine amidotransferase  30.43 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  39.5 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  28.02 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  30.52 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  38.84 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  27.62 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  31.84 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  28.17 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  30.86 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  29.07 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  36.21 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  30.19 
 
 		 525 aa  66.2  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  30.19 
 
 		 525 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  32.64 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  30.5 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  30.19 
 
 		 525 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  30.19 
 
 		 525 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  30.19 
 
 		 525 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  30.19 
 
 		 525 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  29.56 
 
 		 525 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  29.56 
 
 		 525 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  30.19 
 
 		 525 aa  65.5  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  29.56 
 
 		 525 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  30.19 
 
 		 525 aa  65.5  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  30.19 
 
 		 525 aa  65.5  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  30.19 
 
 		 525 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  30.19 
 
 		 525 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  28.91 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  41.41 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  35.34 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  29.07 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  27.54 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  27.7 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  28.9 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  39.8 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  29.79 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  34.81 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  28.5 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  35.98 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  29.53 
 
 		 525 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0768  glutamine amidotransferase class-I  29.31 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1717  glutamine amidotransferase class-I  37.19 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  32.21 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  28.85 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  31.71 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  31.54 
 
 		 516 aa  62  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2333  glutamine amidotransferase class-I  30.86 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  31.29 
 
 		 510 aa  61.6  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  29.82 
 
 		 513 aa  60.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4275  glutamine amidotransferase class-I  31.68 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  31.25 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2728  GMP synthase, large subunit  30.38 
 
 		 525 aa  60.1  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  26.44 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  24 
 
 		 507 aa  60.1  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1128  GMP synthase, large subunit  28.93 
 
 		 525 aa  60.1  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340292  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4193  GMP synthase  28.42 
 
 		 525 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  31.51 
 
 		 512 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  35 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4214  glutamine amidotransferase  26.84 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  28.93 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  31.51 
 
 		 512 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B17  GMP synthase  23.33 
 
 		 511 aa  58.9  0.00000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>