More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_30350 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_30350  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 245 aa  493  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1800  glutamine amidotransferase  52.05 
 
 		 242 aa  246  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3327  glutamine amidotransferase  52.24 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  51.43 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1270  glutamine amidotransferase  50.2 
 
 		 243 aa  239  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17353  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1315  glutamine amidotransferase  50 
 
 		 243 aa  228  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000170552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0014  glutamine amidotransferase  51.43 
 
 		 244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2609  glutamine amidotransferase class-I  51.05 
 
 		 264 aa  221  8e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3824  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  50 
 
 		 244 aa  219  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.14887  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14740  glutamine amidotransferase  47.13 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.216669 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03160  glutamine amidotransferase  50.79 
 
 		 264 aa  212  3.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4570  glutamine amidotransferase  46.53 
 
 		 243 aa  206  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  46.84 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2980  glutamine amidotransferase  45.87 
 
 		 260 aa  205  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0885879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1289  glutamine amidotransferase  41.46 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0579596  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  42.62 
 
 		 243 aa  179  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  33.5 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  34.32 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  34.44 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  33.5 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  37.5 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  37.41 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  33.01 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  28.98 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  37.93 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  40.68 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  29.94 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  31.25 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  30.77 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  29.12 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  31.63 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  33.56 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  25.53 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  29.68 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  33.79 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  32.91 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  29.61 
 
 		 510 aa  65.5  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  30.26 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  32.03 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  31.41 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  28.41 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  30.38 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  29.25 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  28.41 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  31.74 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0195  GMP synthase  27.78 
 
 		 520 aa  62.4  0.000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.284915  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  31.48 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  26.6 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  25.26 
 
 		 238 aa  62  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  32.95 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  29.8 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  33.33 
 
 		 515 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  31.14 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  33.94 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  28 
 
 		 511 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  28.93 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  32.43 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  27.23 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  33.54 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  27.92 
 
 		 517 aa  58.9  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0589  GMP synthase  28.93 
 
 		 506 aa  58.5  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  30.27 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  30.97 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  31.15 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  30.5 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  29.41 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  31.21 
 
 		 278 aa  57  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  25.32 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  31.79 
 
 		 533 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  28.07 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B17  GMP synthase  26.32 
 
 		 511 aa  56.6  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0523  glutamine amidotransferase, class I  26.21 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.947174  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2184  GMP synthase, large subunit  28.1 
 
 		 507 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  34.16 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  28.39 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  27.63 
 
 		 511 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  25.42 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  28.66 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4150  glutamine amidotransferase  30.13 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0768  glutamine amidotransferase class-I  27.93 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  31.15 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  29.87 
 
 		 516 aa  55.1  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1717  glutamine amidotransferase class-I  34.42 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.37682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  32.05 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  24.86 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0408  GMP synthase  28.77 
 
 		 525 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000376888  decreased coverage  0.00000308048 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1303  GMP synthase  28.77 
 
 		 525 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.222556  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  27.98 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1196  GMP synthase  28.77 
 
 		 525 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000372416  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.29 
 
 		 526 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2079  glutamine amidotransferase  25.97 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  27.4 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14111  glutamine amidotransferase class-I  26.07 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  26.67 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2697  GMP synthase  29.87 
 
 		 509 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0477  GMP synthase  26.97 
 
 		 511 aa  53.5  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  29.41 
 
 		 534 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0598  GMP synthase  31.17 
 
 		 505 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  27.16 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  27.45 
 
 		 511 aa  53.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>