More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1030 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1030  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 224 aa  432  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0044853  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2398  glutamine amidotransferase class-I  45.59 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1094  glutamine amidotransferase class-I  43.5 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3511  glutamine amidotransferase class-I  45 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175158  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3000  glutamine amidotransferase class-I  43.66 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.372191  normal  0.238787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3244  glutamine amidotransferase class-I  39.78 
 
 		 240 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3306  glutamine amidotransferase class-I  39.78 
 
 		 240 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0142588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3255  glutamine amidotransferase class-I  39.78 
 
 		 240 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4360  DGPFAETKE family protein  35.25 
 
 		 389 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0876  hypothetical protein  36.41 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3027  glutamine amidotransferase class-I  34.46 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.221271  normal  0.961098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  38.2 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1045  glutamine amidotransferase class-I  34.97 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0800  glutamine amidotransferase class-I  31.72 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  36.52 
 
 		 228 aa  92  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3102  glutamine amidotransferase class-I  40.91 
 
 		 237 aa  92  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.830668  normal  0.133558 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  31.98 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2153  glutamine amidotransferase class-I  33.13 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  34.25 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  30 
 
 		 227 aa  89  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0438  hypothetical protein  36.11 
 
 		 241 aa  89  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.696957 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  37.29 
 
 		 231 aa  86.7  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3928  glutamine amidotransferase  32.43 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000139005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3185  glutamine amidotransferase class-I  29.57 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620946 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  28.42 
 
 		 220 aa  86.3  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1413  glutamine amidotransferase class-I  34.71 
 
 		 237 aa  86.3  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  35.8 
 
 		 228 aa  85.9  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3062  glutamine amidotransferase  31.47 
 
 		 237 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12719  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13091  hypothetical protein  26.87 
 
 		 245 aa  85.5  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  36.5 
 
 		 237 aa  85.5  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  36.5 
 
 		 237 aa  85.5  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  35.23 
 
 		 228 aa  85.1  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  33.18 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2029  glutamine amidotransferase  34.88 
 
 		 288 aa  85.1  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0280  glutamine amidotransferase class-I  35.09 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  32.43 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13021  hypothetical protein  26.87 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4418  glutamine amidotransferase class-I  36.42 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100332  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0004  glutamine amidotransferase  32.88 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.829136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  33.69 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1342  glutamine amidotransferase class-I  25.82 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0212  glutamine amidotransferase class-I  30.54 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0137633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  33.87 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  34.81 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0080  glutamine amidotransferase class-I  34.91 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.780681  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1356  glutamine amidotransferase class-I  32.7 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  0.0346104 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0325  glutamine amidotransferase class-I  40.46 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.939059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  36.13 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  25.43 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1837  glutamine amidotransferase (class I)  25.88 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1960  glutamine amidotransferase class-I  32.97 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2575  glutamine amidotransferase class-I  34.18 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  29.86 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  34.62 
 
 		 276 aa  78.2  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0070  glutamine amidotransferase  31.38 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06241  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  30.54 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.301485  normal  0.247635 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2011  glutamine amidotransferase  32.79 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569772  normal  0.0333945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  31.36 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3715  glutamine amidotransferase  34.64 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  hitchhiker  0.0051367 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2984  glutamine amidotransferase  32.6 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0089  glutamine amidotransferase  33.55 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  29.89 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08781  glutamine amidotransferase class-I  26.5 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3252  glutamine amidotransferase  31.91 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1369  glutamine amidotransferase  35.48 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0062  glutamine amidotransferase  31.38 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1309  glutamine amidotransferase class-I  31.11 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.958114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  32.24 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  35.19 
 
 		 278 aa  75.1  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0071  glutamine amidotransferase  32.04 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2237  glutamine amidotransferase class-I  29.65 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  37.71 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0664  glutamine amidotransferase  33.03 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0983  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  34.41 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0112  glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0071  glutamine amidotransferase  32.12 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  33.16 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  31.69 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1658  glutamine amidotransferase class-I  29.17 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1592  glutamine amidotransferase class-I  29.17 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0998  glutamine amidotransferase  32.11 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.297329  normal  0.152626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  33.7 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  30.85 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0212  glutamine amidotransferase  30.85 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  35.45 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0120  glutamine amidotransferase class-I  29.57 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.173419 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3391  glutamine amidotransferase  30.85 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  30.85 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4011  glutamine amidotransferase  30.85 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  30.85 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  30.85 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0273  glutamine amidotransferase  31.19 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1855  glutamine amidotransferase  33.51 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.332944  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  30.68 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  35.71 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1893  glutamine amidotransferase class-I  31.03 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4250  glutamine amidotransferase class-I  34.04 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  31.68 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  26.82 
 
 		 228 aa  72  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>