140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0644 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  474  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  54.55 
 
 
242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0336  SNARE associated Golgi protein  59 
 
 
243 aa  242  5e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100106  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  56.22 
 
 
238 aa  241  9e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0314  hypothetical protein  55.79 
 
 
245 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0071  ribosomal protein S16  59.35 
 
 
219 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  44.05 
 
 
714 aa  177  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  45.97 
 
 
246 aa  172  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  42.79 
 
 
714 aa  162  6e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  35.71 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  39.15 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  34.36 
 
 
224 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  31.28 
 
 
239 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  36.32 
 
 
226 aa  105  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  33.47 
 
 
224 aa  102  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  32.91 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  35.91 
 
 
228 aa  99.4  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  32.97 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0353  hypothetical protein  37.7 
 
 
251 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.534909  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.64 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  33.48 
 
 
220 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  32.23 
 
 
229 aa  92  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.65 
 
 
717 aa  89.7  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  34.55 
 
 
267 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  34.13 
 
 
231 aa  89.4  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  39.35 
 
 
722 aa  89.4  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  30.37 
 
 
229 aa  85.1  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  32.11 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.53 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.18 
 
 
746 aa  81.6  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  30.77 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  29.94 
 
 
282 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  34.5 
 
 
233 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  29.94 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  34.05 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  30.26 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.28 
 
 
722 aa  75.5  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  32.45 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.28 
 
 
722 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.39 
 
 
713 aa  74.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  28.64 
 
 
717 aa  73.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  31.25 
 
 
738 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  31.46 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  32.04 
 
 
716 aa  72.4  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5116  SNARE associated Golgi protein  36.13 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0230312  hitchhiker  0.00408274 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  34.97 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  28.7 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.81 
 
 
705 aa  70.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.96 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  35.14 
 
 
716 aa  69.7  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  30.34 
 
 
713 aa  69.7  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.18 
 
 
712 aa  69.3  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  37.88 
 
 
325 aa  68.9  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  28.64 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  29.86 
 
 
623 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  32.02 
 
 
704 aa  66.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  33.81 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  32.03 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  32.09 
 
 
264 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
720 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  34.48 
 
 
207 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1919  hypothetical protein  31.51 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3144  hypothetical protein  31.75 
 
 
271 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.552992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  31.58 
 
 
242 aa  63.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.83 
 
 
717 aa  62.8  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0460  hypothetical protein  28.57 
 
 
258 aa  62.4  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.955509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  36.49 
 
 
199 aa  62  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6067  SNARE associated Golgi protein  31.37 
 
 
278 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  32.88 
 
 
229 aa  60.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  29.25 
 
 
238 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  25 
 
 
246 aa  59.7  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  32.18 
 
 
304 aa  58.9  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  31.65 
 
 
213 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  33.08 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  33.08 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  33.08 
 
 
206 aa  55.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  30.11 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4326  SNARE associated Golgi protein  28.17 
 
 
221 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  34.04 
 
 
225 aa  53.1  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  28.57 
 
 
222 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4271  SNARE associated Golgi protein  28.17 
 
 
221 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4466  SNARE associated Golgi protein  28.17 
 
 
221 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  31.5 
 
 
267 aa  52  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  34.86 
 
 
225 aa  52  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  30 
 
 
213 aa  52  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  30 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0659  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.02 
 
 
230 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0859384 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  29.3 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  32.29 
 
 
232 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  27.34 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  28.9 
 
 
225 aa  50.4  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  28.06 
 
 
149 aa  49.7  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0273  hypothetical protein  25.71 
 
 
215 aa  49.3  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.294063  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.26 
 
 
225 aa  48.9  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  25.48 
 
 
231 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1237  SNARE associated Golgi protein  26.2 
 
 
236 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  26.62 
 
 
236 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>