More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4116 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4116  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
363 aa  742    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  47.89 
 
 
356 aa  332  5e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2241  oxidoreductase domain protein  48.6 
 
 
361 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  0.22056 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2533  oxidoreductase domain protein  48.6 
 
 
357 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0157931  normal  0.269514 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4497  oxidoreductase domain protein  45.94 
 
 
357 aa  303  4.0000000000000003e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0113916  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2274  oxidoreductase domain protein  44.92 
 
 
362 aa  293  4e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1560  oxidoreductase domain protein  42.62 
 
 
366 aa  271  1e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  37.43 
 
 
370 aa  213  3.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6624  oxidoreductase domain-containing protein  36.16 
 
 
433 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166678  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  36.92 
 
 
435 aa  193  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3251  oxidoreductase domain-containing protein  36.73 
 
 
435 aa  193  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0158869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 
468 aa  192  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3575  oxidoreductase domain protein  36.73 
 
 
435 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355394  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1247  dehydrogenase  33.04 
 
 
438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210808  normal  0.499874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3487  oxidoreductase domain protein  33.62 
 
 
458 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0826  oxidoreductase domain-containing protein  34.12 
 
 
432 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283328 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 
384 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 
384 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  32.07 
 
 
388 aa  159  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  30.9 
 
 
365 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4729  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 
385 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589222  hitchhiker  0.00784744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 
372 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02580  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  30.29 
 
 
384 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153048  normal  0.354075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 
369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  29.63 
 
 
362 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0630  oxidoreductase domain protein  28.49 
 
 
374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0605312  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5114  oxidoreductase domain protein  28.45 
 
 
392 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  27.99 
 
 
365 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  31.18 
 
 
405 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3948  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 
374 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.252909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3862  oxidoreductase domain protein  29.25 
 
 
374 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  32.31 
 
 
332 aa  134  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 
405 aa  133  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  31.55 
 
 
330 aa  133  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04621  glucose-fructose oxidoreductase  29.38 
 
 
369 aa  132  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  32.85 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  32.54 
 
 
324 aa  129  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  27.79 
 
 
372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  29.46 
 
 
344 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 
349 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4538  oxidoreductase domain-containing protein  30.41 
 
 
405 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178107 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  26.35 
 
 
321 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6056  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 
331 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 
328 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 
328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  30.36 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  31.79 
 
 
335 aa  112  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  25 
 
 
328 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  30.46 
 
 
378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  30.58 
 
 
344 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  27.98 
 
 
328 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  30.18 
 
 
347 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 
342 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 
344 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  27.06 
 
 
345 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  32.37 
 
 
366 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  31.06 
 
 
329 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1913  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 
334 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.148416 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0724  glucose--fructose oxidoreductase  26.29 
 
 
375 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3940  oxidoreductase-like  29.29 
 
 
330 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  29.62 
 
 
328 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3379  oxidoreductase, NAD binding  29.17 
 
 
328 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586771  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0619  oxidoreductase domain-containing protein  28.63 
 
 
325 aa  100  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000252275  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4310  oxidoreductase domain-containing protein  29.45 
 
 
336 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.42 
 
 
347 aa  99.8  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3595  oxidoreductase domain-containing protein  31 
 
 
331 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  31.91 
 
 
359 aa  99.4  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0605  oxidoreductase domain-containing protein  27.67 
 
 
325 aa  98.6  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000161871  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  25.15 
 
 
333 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  31.99 
 
 
343 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  25.37 
 
 
337 aa  97.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3554  oxidoreductase, NAD binding  29.58 
 
 
328 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.487225  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3652  oxidoreductase  28.65 
 
 
337 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502003  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3523  oxidoreductase, NAD binding  29.58 
 
 
328 aa  97.8  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02956  predicted NAD(P)-binding dehydrogenase  29.58 
 
 
334 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02906  hypothetical protein  29.58 
 
 
334 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  30.6 
 
 
334 aa  97.1  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  31.51 
 
 
332 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  27.55 
 
 
337 aa  97.1  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  27.11 
 
 
334 aa  96.7  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  34.3 
 
 
338 aa  96.7  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.76 
 
 
338 aa  95.5  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  30.51 
 
 
330 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0626  oxidoreductase domain-containing protein  26.59 
 
 
334 aa  94  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.45032  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3174  oxidoreductase domain-containing protein  26.33 
 
 
333 aa  94  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04142  predicted oxidoreductase  27.76 
 
 
372 aa  94  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0614  oxidoreductase domain protein  29.26 
 
 
328 aa  94  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276096  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3721  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 
372 aa  94  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0613  oxidoreductase domain-containing protein  29.26 
 
 
328 aa  94  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3269  oxidoreductase, NAD binding  29.26 
 
 
328 aa  94  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4401  oxidoreductase, NAD binding  28.94 
 
 
328 aa  94  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.259305  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  25.22 
 
 
340 aa  93.6  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  28.36 
 
 
327 aa  93.2  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  27.97 
 
 
330 aa  92.8  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3542  oxidoreductase domain-containing protein  29.67 
 
 
332 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0029  oxidoreductase domain-containing protein  29.8 
 
 
373 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373971  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  25.88 
 
 
388 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 
334 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>