More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3144 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3144  ribonuclease BN  100 
 
 
438 aa  848    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1457  ribonuclease BN  68.15 
 
 
484 aa  608  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2359  ribonuclease BN  40.23 
 
 
437 aa  276  6e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.389707  normal  0.121008 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1535  ribonuclease BN  43.08 
 
 
469 aa  261  2e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3200  ribonuclease BN  41.04 
 
 
258 aa  182  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1631  ribonuclease BN  34.29 
 
 
397 aa  176  8e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3484  ribonuclease BN  31.9 
 
 
378 aa  168  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2446  ribonuclease BN  40.35 
 
 
263 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.805614  hitchhiker  0.00565169 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0865  ribonuclease BN  36.63 
 
 
342 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.756909  normal  0.214041 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2153  ribonuclease BN  39.02 
 
 
260 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3221  ribonuclease BN  34.9 
 
 
278 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0711  ribonuclease BN  48.94 
 
 
191 aa  117  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0260  ribonuclease BN  32.44 
 
 
270 aa  102  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1009  ribonuclease BN  31.62 
 
 
301 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2816  ribonuclease BN  34.48 
 
 
285 aa  90.5  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  25.56 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0257  ribonuclease BN  32.27 
 
 
391 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  25.28 
 
 
283 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2378  ribonuclease BN  34.63 
 
 
261 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  24.63 
 
 
363 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  25.83 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  26.62 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  25.17 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  25.64 
 
 
296 aa  72  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  27.53 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  24.26 
 
 
277 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  26.8 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  26.07 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  24.51 
 
 
289 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  27.87 
 
 
324 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0581  ribonuclease BN  27.78 
 
 
446 aa  67  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000420999  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  22.08 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  29.53 
 
 
323 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  29.92 
 
 
328 aa  66.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  24.1 
 
 
289 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1819  putative ribonuclease BN  22.78 
 
 
442 aa  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.193645 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03526  ribonuclease BN  24.07 
 
 
294 aa  65.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0234008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  24.9 
 
 
288 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0594  ribonuclease BN  26.46 
 
 
446 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000174757 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  24.9 
 
 
288 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2938  ribonuclease BN  24.18 
 
 
310 aa  65.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  24.8 
 
 
286 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5884  ribonuclease BN  23.55 
 
 
499 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  25.13 
 
 
443 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  29.89 
 
 
292 aa  64.7  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  29.89 
 
 
292 aa  65.1  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0764  ribonuclease BN  25.29 
 
 
452 aa  64.3  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  24.51 
 
 
289 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  24.51 
 
 
289 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  24.51 
 
 
289 aa  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  24.51 
 
 
289 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  24.51 
 
 
289 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  24.51 
 
 
289 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  25.75 
 
 
311 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  24.5 
 
 
298 aa  63.9  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3478  ribonuclease BN  24.2 
 
 
289 aa  63.9  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  29.1 
 
 
321 aa  63.5  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0697  ribonuclease BN, putative  28.47 
 
 
429 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47498  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0732  ribonuclease BN  28.47 
 
 
439 aa  63.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3708  ribonuclease BN  26.52 
 
 
337 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.153225 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  27.27 
 
 
277 aa  63.2  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  26.95 
 
 
330 aa  63.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  26.12 
 
 
308 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2112  ribonuclease BN  26.74 
 
 
425 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181145  normal  0.117227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  25.97 
 
 
360 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  27.19 
 
 
349 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  27.27 
 
 
311 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  26.12 
 
 
314 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  26.12 
 
 
314 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  25.75 
 
 
336 aa  63.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0733  ribonuclease BN  28.47 
 
 
439 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  26.47 
 
 
318 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0609  ribonuclease BN  23.86 
 
 
303 aa  62.4  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0138634  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0311  ribonuclease BN  23.99 
 
 
337 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  26.47 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  27.92 
 
 
289 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0698  hypothetical protein  26.64 
 
 
412 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0680  hypothetical protein  26.64 
 
 
412 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  25.68 
 
 
304 aa  61.6  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  29.66 
 
 
319 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0314  ribonuclease BN  24.67 
 
 
323 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321317  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0315  ribonuclease BN  24.67 
 
 
323 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0319  ribonuclease BN  24.67 
 
 
323 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  27.85 
 
 
436 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  25.83 
 
 
337 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  23.1 
 
 
340 aa  61.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  28.07 
 
 
313 aa  60.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0320  ribonuclease BN  24.67 
 
 
323 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0316  ribonuclease BN  25.96 
 
 
337 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.293845  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  24.81 
 
 
299 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  25.9 
 
 
338 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  25.9 
 
 
338 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  24.44 
 
 
299 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  25.74 
 
 
328 aa  60.1  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  25.18 
 
 
338 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0964  ribonuclease BN  28.17 
 
 
285 aa  60.1  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  25.83 
 
 
307 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  27.08 
 
 
333 aa  60.1  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  25.83 
 
 
307 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  25.83 
 
 
307 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>