More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2554 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2554  ribosomal protein S13P  100 
 
 		 174 aa  349  1e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0420  ribosomal protein S13P  87.97 
 
 		 171 aa  286  1e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2524  30S ribosomal protein S13P  70.06 
 
 		 176 aa  231  5e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00788045  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2589  30S ribosomal protein S13P  75.89 
 
 		 178 aa  229  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.191208  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1816  30S ribosomal protein S13P  70.06 
 
 		 174 aa  225  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2225  30S ribosomal protein S13P  51.75 
 
 		 153 aa  158  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1800  30S ribosomal protein S13P  51.75 
 
 		 149 aa  157  7e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411699  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2902  30S ribosomal protein S13P  50.69 
 
 		 151 aa  155  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0078  30S ribosomal protein S13P  48.98 
 
 		 162 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2388  30S ribosomal protein S13P  47.92 
 
 		 151 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1247  30S ribosomal protein S13P  46.53 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000201962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0036  30S ribosomal protein S13P  46.48 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1618  30S ribosomal protein S13P  43.24 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1396  ribosomal protein S13P  40.85 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.837984  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0972  30S ribosomal protein S13P  43.66 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0987409 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1421  30S ribosomal protein S13P  42.96 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.839715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0910  30S ribosomal protein S13P  41.55 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1894  30S ribosomal protein S13P  39.44 
 
 		 152 aa  111  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0502  30S ribosomal protein S13P  41.18 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03110  ribosomal protein S18, putative  36.99 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710402  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05441  ribosomal protein S13p/S18e (AFU_orthologue; AFUA_6G13550)  35.92 
 
 		 155 aa  99.8  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.22167 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78465  ribosomal protein S18B  36.62 
 
 		 145 aa  99.8  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0274  30S ribosomal protein S13P  36.62 
 
 		 149 aa  98.6  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0564  30S ribosomal protein S13P  35.92 
 
 		 149 aa  97.4  9e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1354  30S ribosomal protein S13P  35.92 
 
 		 149 aa  97.4  9e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239883  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0630  30S ribosomal protein S13P  35.92 
 
 		 149 aa  97.1  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30486  predicted protein  36.3 
 
 		 146 aa  93.6  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29591  Ribosomal protein S18, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  34.07 
 
 		 144 aa  93.2  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0325  30S ribosomal protein S13P  32.62 
 
 		 194 aa  89  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1101  30S ribosomal protein S13P  30.77 
 
 		 149 aa  88.6  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0259  30S ribosomal protein S13P  37.32 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2148  30S ribosomal protein S13P  33.33 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000612517  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1055  ribosomal protein S13P  37.76 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0133675  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 132 aa  60.8  0.00000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0439  ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  30.71 
 
 		 122 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0302  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420412  hitchhiker  0.0000142456 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  26.92 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4254  ribosomal protein S13  29.77 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589947  unclonable  0.00000000000214653 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 128 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 128 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0447  30S ribosomal protein S13  29.01 
 
 		 118 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000202005  hitchhiker  0.00280445 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0480  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 119 aa  53.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 118 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5058  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 118 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000365808  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  31.06 
 
 		 122 aa  52.8  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  29.29 
 
 		 123 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 118 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.448669 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  25.95 
 
 		 125 aa  51.6  0.000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 122 aa  51.6  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0324  30S ribosomal protein S13  26.92 
 
 		 120 aa  51.6  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  30 
 
 		 121 aa  51.2  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  26.92 
 
 		 122 aa  50.8  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 122 aa  50.8  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0204  30S ribosomal protein S13  26.62 
 
 		 129 aa  50.8  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  27.69 
 
 		 122 aa  50.8  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  28.24 
 
 		 123 aa  50.8  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0476  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 118 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231121 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  29.01 
 
 		 123 aa  50.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4727  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 118 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478097  normal  0.348822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  28.57 
 
 		 126 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  32.12 
 
 		 125 aa  50.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 123 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0505  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 118 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0287  30S ribosomal protein S13  25.36 
 
 		 123 aa  50.4  0.00001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0509  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 118 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176791  hitchhiker  0.00957459 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  29.01 
 
 		 122 aa  50.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  29.32 
 
 		 122 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 127 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0351  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.069435  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2304  30S ribosomal protein S13  26.72 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.974192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  30.6 
 
 		 127 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06470  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 125 aa  50.1  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0342  30S ribosomal protein S13  26.15 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158727  hitchhiker  0.00039866 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  32.14 
 
 		 123 aa  49.7  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 122 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 122 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0476  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 129 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389275  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0521  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.148461  unclonable  0.0000000000153746 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2350  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 118 aa  49.3  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0765  ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0253  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  28.37 
 
 		 123 aa  49.3  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0275  30S ribosomal protein S13  30.3 
 
 		 125 aa  49.3  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  27.48 
 
 		 122 aa  49.3  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0192  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000985744  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0221  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224904  unclonable  0.0000000000165465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0216  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000313091  hitchhiker  0.00577803 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0221  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000205657  unclonable  0.0000000000430972 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0506  30S ribosomal protein S13  27.69 
 
 		 118 aa  48.5  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00117339  normal  0.0273818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>