More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_10770 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_10770  uridine kinase  100 
 
 		 549 aa  1109    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0332  phosphoribulokinase/uridine kinase  54.95 
 
 		 557 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1290  phosphoribulokinase/uridine kinase  54.14 
 
 		 547 aa  561  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.297478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0041  phosphoribulokinase/uridine kinase  50.09 
 
 		 554 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.448598  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1101  uridine kinase  51.76 
 
 		 557 aa  538  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1435  AAA ATPase  48.82 
 
 		 552 aa  525  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  48.2 
 
 		 558 aa  518  1e-146  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3162  phosphoribulokinase/uridine kinase  48.17 
 
 		 552 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  51.78 
 
 		 555 aa  508  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  50.63 
 
 		 555 aa  508  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0531  AAA ATPase  51.07 
 
 		 554 aa  497  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.777332  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1763  phosphoribulokinase/uridine kinase  50.46 
 
 		 559 aa  484  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.295373  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3519  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.47 
 
 		 553 aa  479  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1435  phosphoribulokinase/uridine kinase  45.84 
 
 		 553 aa  465  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0031  phosphoribulokinase/uridine kinase  46.11 
 
 		 555 aa  461  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1745  phosphoribulokinase family protein  43.27 
 
 		 529 aa  452  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1554  putative threonyl-tRNA synthetase/uridine kinase  48.3 
 
 		 551 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.614355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1347  phosphoribulokinase / uridine kinase family protein  45.69 
 
 		 551 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1361  AAA ATPase  43.71 
 
 		 547 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.762498  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2238  phosphoribulokinase/uridine kinase  42.11 
 
 		 567 aa  432  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.958517  normal  0.150287 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2289  phosphoribulokinase/uridine kinase family protein  44.19 
 
 		 550 aa  407  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3054  phosphoribulokinase/uridine kinase  44.65 
 
 		 462 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3852  cyclic nucleotide-binding protein  36.38 
 
 		 713 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3723  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.97 
 
 		 714 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3863  cyclic nucleotide-binding protein  32.37 
 
 		 715 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3780  cyclic nucleotide-binding protein  32.37 
 
 		 715 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12201  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 		 646 aa  97.8  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 635 aa  94  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  26.06 
 
 		 639 aa  90.1  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 640 aa  88.6  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 		 635 aa  88.6  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  31.49 
 
 		 662 aa  88.2  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 640 aa  88.2  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 		 635 aa  87.8  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  28.72 
 
 		 641 aa  87.8  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 		 640 aa  87  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 		 637 aa  85.9  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  23.98 
 
 		 634 aa  84.3  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 		 634 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 635 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 		 635 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 		 633 aa  83.2  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  26.06 
 
 		 641 aa  82.8  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1373  threonyl-tRNA synthetase  28.49 
 
 		 645 aa  82  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000340223  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 		 635 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 		 635 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 		 635 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  26.63 
 
 		 639 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 		 638 aa  80.9  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1415  threonyl-tRNA synthetase  26.34 
 
 		 643 aa  80.9  0.00000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260393 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  27.42 
 
 		 636 aa  80.5  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 		 646 aa  80.5  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  27.17 
 
 		 635 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  27.17 
 
 		 635 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0033  threonyl-tRNA synthetase  27.37 
 
 		 641 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.611945  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 		 635 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 		 635 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 		 635 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  27.17 
 
 		 635 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  28.8 
 
 		 643 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 		 647 aa  77.8  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  26.5 
 
 		 635 aa  77.8  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 		 640 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 		 640 aa  77.4  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  29.86 
 
 		 504 aa  77.4  0.0000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  28 
 
 		 634 aa  77  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 639 aa  77  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1448  threonyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 639 aa  77  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 		 642 aa  77  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 		 635 aa  77  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06621  threonyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 		 638 aa  77  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.296705  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 639 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 639 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 639 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1007  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  24.08 
 
 		 637 aa  75.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.245371  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  26.6 
 
 		 638 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 639 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  26.09 
 
 		 635 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  24.02 
 
 		 633 aa  75.5  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  26.11 
 
 		 635 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  28.29 
 
 		 640 aa  75.5  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 640 aa  75.1  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  24.44 
 
 		 638 aa  74.7  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 		 638 aa  74.7  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  22.65 
 
 		 636 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  25.56 
 
 		 653 aa  73.9  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  24.46 
 
 		 639 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  27.17 
 
 		 639 aa  74.3  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  23.96 
 
 		 643 aa  73.9  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3025  threonyl-tRNA synthetase  24.74 
 
 		 638 aa  73.9  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 		 635 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 		 635 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 643 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1385  uridine kinase  30.85 
 
 		 209 aa  73.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 		 635 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 		 635 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 		 635 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 		 635 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1721  threonyl-tRNA synthetase  25.66 
 
 		 648 aa  73.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  25.54 
 
 		 635 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>