299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2074 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  100 
 
 
286 aa  576  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  43.31 
 
 
293 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  44.88 
 
 
290 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  40.61 
 
 
284 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  46.36 
 
 
226 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  37.81 
 
 
295 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  37.69 
 
 
300 aa  162  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  37.59 
 
 
298 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  37.31 
 
 
290 aa  145  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  40.54 
 
 
450 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1468  NmrA family protein  35.19 
 
 
306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  34.63 
 
 
315 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  37.59 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  34.62 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  32.63 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0390  NADPH-dependent reductase  28.48 
 
 
345 aa  115  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0157595  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  34.84 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10751  hypothetical protein  28.77 
 
 
345 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0490933  normal  0.0263054 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07641  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.45 
 
 
316 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.497854  hitchhiker  0.00491457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  32.04 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1169  NADPH-dependent reductase  29.54 
 
 
336 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437818  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  31.03 
 
 
288 aa  106  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  24.12 
 
 
273 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  24.12 
 
 
273 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04608  NmrA family transcriptional regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06920)  31.38 
 
 
309 aa  106  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.113865  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2282  NmrA family protein  31.99 
 
 
319 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2828  NmrA family protein  33.33 
 
 
305 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01600  conserved hypothetical protein  29.15 
 
 
318 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.561734  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04620  hypothetical protein  28.63 
 
 
309 aa  102  9e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599307  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  29.96 
 
 
303 aa  98.6  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0874  NmrA family protein  33.33 
 
 
317 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0766  NmrA family protein  33.05 
 
 
317 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0676287  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4428  NmrA family protein  30.03 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183796  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04630  conserved hypothetical protein  28.03 
 
 
311 aa  93.2  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.361856  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3675  NmrA-like  29.89 
 
 
315 aa  92.8  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.12291  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00760  conserved hypothetical protein  25.67 
 
 
294 aa  92.8  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.041622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  30 
 
 
300 aa  92.4  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3361  NmrA family protein  33.1 
 
 
300 aa  89.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.118404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2208  NmrA family protein  31.99 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0821  hypothetical protein  25.5 
 
 
326 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.107577  unclonable  0.0000119354 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  30.93 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01819  conserved hypothetical protein  27.03 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520002  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1053  NmrA-like protein  30.71 
 
 
315 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1069  NmrA family protein  30.71 
 
 
315 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  27.47 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1080  NmrA family protein  30.31 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.803259  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  27.9 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  28.57 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  27.52 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  28.21 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  28.63 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  27.9 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  27.9 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  28.76 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  27.9 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.2 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  31.36 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  25.94 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09332  conserved hypothetical protein  33.57 
 
 
324 aa  68.9  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0602529  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2632  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  30.3 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  28.86 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  29.24 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12330  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.23 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5281  NmrA family protein  28.87 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  30.23 
 
 
323 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  28.51 
 
 
289 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  30.23 
 
 
323 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.42 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3958  NmrA family protein  27.66 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.86 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  26.82 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  27.16 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  26.87 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.45 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.02 
 
 
286 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  29.91 
 
 
289 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  26.29 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.33 
 
 
320 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  26.77 
 
 
293 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  31.03 
 
 
320 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.19 
 
 
320 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
305 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4354  NmrA family protein  27.54 
 
 
287 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  29.17 
 
 
295 aa  62.4  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09354  conserved hypothetical protein  31.51 
 
 
311 aa  61.6  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.471482  hitchhiker  0.00666218 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3405  NmrA family protein  32.34 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.455862 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5710  NmrA family protein  27.31 
 
 
292 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.107239  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  30.23 
 
 
280 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  27.05 
 
 
292 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  29.03 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2314  NmrA family protein  31.13 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  25.62 
 
 
292 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  32.47 
 
 
320 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0196  NmrA family protein  29.3 
 
 
295 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  34 
 
 
297 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1072  NmrA family protein  31.3 
 
 
288 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07166  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.64 
 
 
295 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  29.1 
 
 
274 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
295 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>