182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2314 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2314  NmrA family protein  100 
 
 		 289 aa  587  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1499  NmrA family protein  33.48 
 
 		 224 aa  85.5  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.224816  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  28.41 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  31.54 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  30 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  30.04 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  29.03 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  29.73 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00524  conserved hypothetical protein  28.95 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  25 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  28.83 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  27.27 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.84 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  28.96 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  26.07 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  28.83 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  25.2 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  25.6 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.11 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  29.14 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  30.54 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  35.92 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  27.57 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  26.46 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  26.83 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  28.05 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  28.05 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  29.46 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  28.96 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  24.73 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  27.51 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  28.51 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  27.34 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.08 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  25.94 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  27.56 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  28.26 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  27.33 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  25.12 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  25.09 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  27.11 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  31.43 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2074  NmrA family protein  31.13 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  29.32 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  28.28 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  22.54 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  25.41 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  27.13 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.73 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  28.34 
 
 		 294 aa  52.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  28.51 
 
 		 295 aa  52.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  46.55 
 
 		 357 aa  52.8  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  31.85 
 
 		 291 aa  52.4  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  27.18 
 
 		 285 aa  52.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  28.35 
 
 		 276 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  28.03 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  26.91 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  28.74 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  29.31 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  28 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2842  hypothetical protein  38.71 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  26.14 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  33.7 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3888  NmrA family protein  28.3 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203916  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  27.16 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  29.86 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  34.29 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  30.61 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  27.35 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  24.82 
 
 		 294 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2930  NmrA family protein  33.93 
 
 		 284 aa  50.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34 
 
 		 212 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 		 212 aa  49.7  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5395  NmrA family protein  32.06 
 
 		 278 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  24.43 
 
 		 323 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  24.43 
 
 		 323 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  26.76 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01819  conserved hypothetical protein  24.41 
 
 		 343 aa  48.9  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  28.14 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  24.57 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  27.27 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4065  NmrA family protein  22.69 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  26.94 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  32.39 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  37.84 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  25.57 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0479  NmrA family protein  26.91 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  30.26 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  45.61 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  45.76 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  31.01 
 
 		 231 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.33 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  25.32 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  25.32 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  27.06 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  26.61 
 
 		 298 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  25.32 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>