76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1499 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1499  NmrA family protein  100 
 
 		 224 aa  435  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.224816  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2314  NmrA family protein  33.48 
 
 		 289 aa  94.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  28.4 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  31.28 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  34.98 
 
 		 279 aa  62  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  32.7 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  31.13 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  32.41 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  35.29 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  34.76 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  33.82 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  36.59 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  33.01 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  31.07 
 
 		 284 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  25.27 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.75 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  31.19 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  31.94 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  29.69 
 
 		 274 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  32.46 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  31.65 
 
 		 434 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  32.45 
 
 		 271 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  28.99 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  31.22 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  34.29 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  37.25 
 
 		 279 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  28.06 
 
 		 292 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  31.6 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  34.43 
 
 		 271 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  30.77 
 
 		 280 aa  50.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3754  NmrA family protein  36.11 
 
 		 276 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00869752  normal  0.872843 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  27.93 
 
 		 287 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  33.67 
 
 		 285 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  27.75 
 
 		 289 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  25.24 
 
 		 276 aa  49.3  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  30.77 
 
 		 285 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  37.93 
 
 		 284 aa  48.5  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  29.41 
 
 		 281 aa  48.5  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  32.11 
 
 		 584 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  28.87 
 
 		 282 aa  48.5  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  31.55 
 
 		 291 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  29.35 
 
 		 298 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  37.8 
 
 		 283 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  31.65 
 
 		 310 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  31.84 
 
 		 294 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  30.25 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  28.27 
 
 		 281 aa  46.2  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  30.26 
 
 		 278 aa  46.2  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  26.09 
 
 		 290 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  30.43 
 
 		 294 aa  45.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0136  NmrA family protein  31.37 
 
 		 274 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3920  NmrA family protein  30.43 
 
 		 284 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  28.06 
 
 		 289 aa  45.4  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2364  NmrA family protein  30.26 
 
 		 307 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000211111  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  30.72 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  25 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0093  NmrA-like protein  30.22 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  36.62 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3070  hypothetical protein  31.28 
 
 		 344 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  25.54 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.81 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  30.81 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  30.07 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  33.16 
 
 		 283 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  34.97 
 
 		 273 aa  42.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  34.17 
 
 		 283 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  41.1 
 
 		 279 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  28.41 
 
 		 283 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  27.08 
 
 		 279 aa  42.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3907  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.53 
 
 		 330 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.3708 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  28.97 
 
 		 283 aa  42.4  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  30.34 
 
 		 295 aa  42.4  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  29.67 
 
 		 281 aa  42  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  28.84 
 
 		 283 aa  42.4  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  30.89 
 
 		 282 aa  42  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  30.7 
 
 		 288 aa  42  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>