More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0342 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0342  Transketolase domain protein  100 
 
 		 321 aa  653    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  37.16 
 
 		 306 aa  185  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  34.54 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  34.54 
 
 		 314 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  32.11 
 
 		 314 aa  170  3e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  35.74 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  41.49 
 
 		 592 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  34.22 
 
 		 305 aa  166  5e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  33.44 
 
 		 310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  34.29 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  37.07 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  38.02 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  41.89 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  34.21 
 
 		 327 aa  162  6e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  31.31 
 
 		 312 aa  162  6e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  32.78 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  37.98 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  36.05 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  33.77 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  35.86 
 
 		 311 aa  159  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  33.33 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  33.44 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  30.74 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  32.03 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  36.82 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  34.54 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  35.56 
 
 		 332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  36.08 
 
 		 322 aa  155  6e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  31.7 
 
 		 312 aa  155  8e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  36.02 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  36.6 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  35.84 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  34.63 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  33.46 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  34.59 
 
 		 319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  34.62 
 
 		 310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  32.76 
 
 		 317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  33.99 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  39.62 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  34.62 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  32.14 
 
 		 321 aa  153  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  36.98 
 
 		 326 aa  152  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  35.19 
 
 		 326 aa  152  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  30.82 
 
 		 312 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  30.26 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4395  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  35.83 
 
 		 635 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326234  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  34.98 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3958  transketolase subunit B  34.57 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158278  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4569  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  34.85 
 
 		 635 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  37.07 
 
 		 318 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  38.2 
 
 		 323 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  35.86 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  31.03 
 
 		 319 aa  149  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1044  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  34.35 
 
 		 618 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.213907  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  32.05 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  29.7 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  33.33 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  33.33 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4275  transketolase central region  35.58 
 
 		 338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  31.65 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4532  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  34.64 
 
 		 635 aa  146  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  34.34 
 
 		 314 aa  146  6e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  38.74 
 
 		 319 aa  145  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  34.69 
 
 		 333 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  35 
 
 		 325 aa  145  8.000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  34.72 
 
 		 324 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  33.58 
 
 		 313 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2506  Transketolase central region  36.23 
 
 		 343 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.165482 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3618  transketolase subunit B  33.11 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189872  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  34.26 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  36.09 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0471  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  34.94 
 
 		 636 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  32.05 
 
 		 320 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0484  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  34.62 
 
 		 636 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0190528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  36.33 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  35.83 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  33.45 
 
 		 332 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  33.22 
 
 		 348 aa  143  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  34.29 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2699  transketolase subunit B  34.22 
 
 		 288 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4130  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  38.01 
 
 		 632 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000139923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  36.68 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  28.81 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  40.62 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  33.33 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0406  Transketolase central region  34.98 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3042  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  33.44 
 
 		 635 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00899541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  31.6 
 
 		 337 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  35.25 
 
 		 335 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3641  transketolase, central region  32.55 
 
 		 334 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1667  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  34.56 
 
 		 634 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000640226  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  35.25 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  35.29 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  35.66 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  34.63 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  34.63 
 
 		 339 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3347  Transketolase central region  34.98 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.027962  normal  0.023237 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5878  transketolase central region  33.01 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  34.34 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0675  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  33.88 
 
 		 633 aa  136  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>