202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2387 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  70.61 
 
 
484 aa  649    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  71.49 
 
 
487 aa  677    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  100 
 
 
483 aa  959    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  70.54 
 
 
482 aa  657    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  79.75 
 
 
485 aa  756    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  49.47 
 
 
498 aa  434  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  47.15 
 
 
488 aa  413  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  44.42 
 
 
500 aa  390  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  42.04 
 
 
474 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  40.88 
 
 
489 aa  362  8e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  41.98 
 
 
497 aa  358  9e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  40.7 
 
 
487 aa  343  5e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  35.81 
 
 
486 aa  291  2e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  36.02 
 
 
486 aa  290  3e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  39.24 
 
 
496 aa  288  1e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  35.01 
 
 
486 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  39.57 
 
 
478 aa  282  8.000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  38.3 
 
 
547 aa  273  5.000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  33.67 
 
 
487 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  38.43 
 
 
516 aa  269  7e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  32.95 
 
 
511 aa  269  1e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  36.89 
 
 
513 aa  267  4e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  40.6 
 
 
374 aa  242  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  40.47 
 
 
339 aa  231  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  41.02 
 
 
334 aa  231  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  39.22 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  32.29 
 
 
396 aa  173  5.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  34.91 
 
 
399 aa  171  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  34.77 
 
 
393 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  34.14 
 
 
368 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  32.12 
 
 
374 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  32.12 
 
 
374 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  31.88 
 
 
389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  32.94 
 
 
375 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  33.21 
 
 
391 aa  158  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  30.02 
 
 
420 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  29.33 
 
 
420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  29.33 
 
 
420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  29.68 
 
 
408 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  31.25 
 
 
427 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  29.47 
 
 
365 aa  139  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  30.31 
 
 
429 aa  137  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  33.58 
 
 
346 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  30.46 
 
 
341 aa  136  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  30.03 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  34.22 
 
 
346 aa  133  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  27.5 
 
 
324 aa  131  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  30.63 
 
 
349 aa  130  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  30.23 
 
 
346 aa  128  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  28.81 
 
 
393 aa  127  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  31.09 
 
 
347 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  30.42 
 
 
355 aa  126  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  30.04 
 
 
366 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  29.52 
 
 
420 aa  120  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  29.47 
 
 
335 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  28.85 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  27.46 
 
 
335 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  27.24 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  29.28 
 
 
888 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1659  TrkA-N  26.72 
 
 
217 aa  61.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0583689  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  25.96 
 
 
672 aa  60.5  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  30.89 
 
 
220 aa  59.7  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200527  hitchhiker  0.0000000000000167844 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1184  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.34 
 
 
905 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  31.67 
 
 
215 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  29.1 
 
 
880 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  31.78 
 
 
221 aa  57.4  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1041  TrkA domain-containing protein  30.52 
 
 
452 aa  57  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1392  putative TrkA family protein  32.17 
 
 
641 aa  56.6  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0135238 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  30.66 
 
 
215 aa  56.2  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000226197  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1631  Trk family potassium uptake protein , putative  32.76 
 
 
223 aa  54.7  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  32.17 
 
 
219 aa  55.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02541  putative potassium channel, VIC family  36.07 
 
 
234 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 
217 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  33.9 
 
 
224 aa  54.7  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1585  TrkA-N domain protein  25.58 
 
 
216 aa  54.7  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453253  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2551  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  28.81 
 
 
309 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132574  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0379  VIC family potassium channel protein  36.07 
 
 
234 aa  54.3  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  30.32 
 
 
352 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1267  DHH family protein  28.71 
 
 
312 aa  53.9  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  30.58 
 
 
221 aa  53.5  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  30.58 
 
 
221 aa  53.5  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2314  VIC family potassium channel protein  35.48 
 
 
234 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.537657  normal  0.229836 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  31.4 
 
 
227 aa  53.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  30.66 
 
 
347 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  31.36 
 
 
217 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  25.42 
 
 
890 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  30.53 
 
 
218 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2854  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  29.05 
 
 
309 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2635  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  29.05 
 
 
309 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2585  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  29.05 
 
 
309 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000705472  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2832  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  29.05 
 
 
309 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000573837 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2875  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  29.05 
 
 
309 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00391917  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2826  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  29.05 
 
 
309 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704709  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  31.15 
 
 
220 aa  52.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  27.73 
 
 
219 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0137  TRK system potassium uptake protein TrkA, putative  24.73 
 
 
213 aa  51.6  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0818  phosphoesterase domain-containing protein  28.7 
 
 
315 aa  51.6  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3413  diguanylate cyclase and phosphoesterase  25.84 
 
 
658 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  27.73 
 
 
217 aa  51.6  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000130553  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1924  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  28.49 
 
 
310 aa  51.2  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00852354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>