80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3410 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3410  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 398 aa  798    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  32.38 
 
 		 963 aa  75.5  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  29.76 
 
 		 463 aa  69.7  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  27.57 
 
 		 687 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  25.81 
 
 		 1300 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  27.41 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  32.14 
 
 		 705 aa  63.9  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  28.75 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  27.81 
 
 		 475 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  29.76 
 
 		 1454 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  26.92 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1144  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  30.86 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3315  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  26.55 
 
 		 557 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2693  Pyrrolo-quinoline quinone  26.82 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  29.06 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  28.1 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  21.69 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1682 aa  57.4  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2894  Pyrrolo-quinoline quinone  25.65 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0786698  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  31.2 
 
 		 901 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  27.06 
 
 		 653 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  26.42 
 
 		 616 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  25.96 
 
 		 795 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  28.02 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  23.1 
 
 		 2122 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  26.53 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0619  Pyrrolo-quinoline quinone  22.89 
 
 		 373 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.051105  hitchhiker  0.000000261187 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  24.26 
 
 		 322 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  28.47 
 
 		 412 aa  53.5  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  24.92 
 
 		 774 aa  53.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  23.62 
 
 		 322 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  25.69 
 
 		 458 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  27.02 
 
 		 484 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.64 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  22.37 
 
 		 797 aa  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  23 
 
 		 322 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3619  Pyrrolo-quinoline quinone  28.17 
 
 		 581 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.1 
 
 		 1383 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  27.89 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  26.63 
 
 		 439 aa  50.4  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  23 
 
 		 2036 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  23.57 
 
 		 1969 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0204  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  30.73 
 
 		 555 aa  50.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3214  Pyrrolo-quinoline quinone  25.65 
 
 		 349 aa  49.7  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000613548  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3015  Pyrrolo-quinoline quinone  27.95 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  24.17 
 
 		 652 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  25.6 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  28.14 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  23.75 
 
 		 2272 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2638  Pyrrolo-quinoline quinone  28.57 
 
 		 407 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  25.11 
 
 		 486 aa  47.8  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  25.67 
 
 		 397 aa  47  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  25.08 
 
 		 422 aa  46.2  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1993  hypothetical protein  28.93 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.041512 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  25.35 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  26.48 
 
 		 861 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.56 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  26.09 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3316  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  25.54 
 
 		 545 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.09 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.57 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  37.5 
 
 		 440 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.37 
 
 		 392 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  22.43 
 
 		 611 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1173  Pyrrolo-quinoline quinone  26.21 
 
 		 383 aa  44.3  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.579811 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2569  Pyrrolo-quinoline quinone  36.08 
 
 		 531 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  30.25 
 
 		 383 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.11 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.75 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1093  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.21 
 
 		 375 aa  43.9  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.63 
 
 		 392 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.63 
 
 		 392 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.63 
 
 		 392 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.63 
 
 		 392 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  25.52 
 
 		 422 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1547  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.23 
 
 		 395 aa  43.1  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00611389  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  28.43 
 
 		 371 aa  43.1  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.09 
 
 		 392 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>