178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3285 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  100 
 
 		 1432 aa  2917    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  30.55 
 
 		 1612 aa  492  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  37.24 
 
 		 1426 aa  342  2.9999999999999998e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  27.8 
 
 		 1343 aa  270  1e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1022 aa  245  3e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  30.96 
 
 		 1375 aa  245  3.9999999999999997e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1308  putative type II DNA modification enzyme  27.45 
 
 		 1442 aa  243  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102171 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  23.44 
 
 		 1250 aa  240  1e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1250 aa  238  5.0000000000000005e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1332 aa  236  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3627  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1098 aa  231  7e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6769  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1349 aa  221  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  28.45 
 
 		 1338 aa  218  9e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  25.05 
 
 		 1339 aa  210  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1422 aa  209  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1459 aa  205  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1581 aa  204  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  25.7 
 
 		 1338 aa  202  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  26.38 
 
 		 1712 aa  201  9e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  27.28 
 
 		 1322 aa  197  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  27.43 
 
 		 1321 aa  194  9e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1342 aa  185  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  26.89 
 
 		 1354 aa  186  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  26.1 
 
 		 1159 aa  185  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  23.27 
 
 		 1278 aa  184  8.000000000000001e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1321 aa  184  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1353 aa  184  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1545  putative type II DNA modification enzyme  24.64 
 
 		 1318 aa  182  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1243 aa  182  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  27.32 
 
 		 1331 aa  181  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  26.5 
 
 		 1219 aa  179  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  25.25 
 
 		 1336 aa  178  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  23.66 
 
 		 1257 aa  177  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  25.06 
 
 		 1358 aa  177  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1282 aa  177  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  24.63 
 
 		 1277 aa  176  3.9999999999999995e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  34.05 
 
 		 1441 aa  175  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1461 aa  174  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  24.97 
 
 		 1290 aa  174  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1373 aa  172  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  24.17 
 
 		 1319 aa  172  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1363 aa  167  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  26.83 
 
 		 1306 aa  167  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  30.72 
 
 		 1346 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1333 aa  164  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0272  putative type II DNA modification enzyme  28.07 
 
 		 1322 aa  164  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  24.7 
 
 		 1355 aa  163  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1347 aa  162  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0744  hypothetical protein  28.75 
 
 		 1709 aa  161  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1452 aa  157  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  31.49 
 
 		 836 aa  157  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3087  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1572 aa  157  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0122082 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1209 aa  155  5e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  23.35 
 
 		 1244 aa  155  8e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  30.79 
 
 		 1055 aa  153  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1154 aa  153  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1299 aa  152  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  27.79 
 
 		 629 aa  152  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  27.99 
 
 		 995 aa  152  6e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1409 aa  151  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  23.63 
 
 		 1186 aa  151  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  23.24 
 
 		 1132 aa  148  7.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3742  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1575 aa  148  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2728  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1440 aa  148  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.935327 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1417  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1557 aa  145  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1751 aa  145  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35210  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1546 aa  138  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  26.62 
 
 		 518 aa  138  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  29.75 
 
 		 1036 aa  134  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  27.65 
 
 		 557 aa  133  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  27.63 
 
 		 1573 aa  132  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  33.98 
 
 		 846 aa  131  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  27.35 
 
 		 562 aa  131  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1644 aa  127  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5421  putative type II restriction enzyme, methylase subunit  26.32 
 
 		 1581 aa  127  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.689282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1339 aa  126  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1339 aa  126  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1642 aa  126  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1640 aa  125  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  24.01 
 
 		 1640 aa  124  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1147 aa  123  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  27.69 
 
 		 493 aa  122  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1177 aa  121  9e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1354  hypothetical protein  28.75 
 
 		 1579 aa  118  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1347 aa  115  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1104 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1365 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  30.08 
 
 		 974 aa  112  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  23.19 
 
 		 1252 aa  111  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  26.13 
 
 		 1089 aa  110  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1338 aa  110  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.49 
 
 		 1194 aa  110  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1120 aa  107  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  24.68 
 
 		 1041 aa  105  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  23.87 
 
 		 1298 aa  102  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  25.75 
 
 		 1076 aa  102  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  27.8 
 
 		 416 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  34.44 
 
 		 1058 aa  97.8  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  32.07 
 
 		 1366 aa  96.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  26.3 
 
 		 410 aa  93.6  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>