68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1156 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  100 
 
 		 186 aa  359  1e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  64.6 
 
 		 347 aa  142  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1476  halocyanin domain protein  61.95 
 
 		 231 aa  135  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  42.55 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  54.4 
 
 		 212 aa  111  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  56.38 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  52.34 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  47.55 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  51.33 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2576  halocyanin domain protein  35.02 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  51.72 
 
 		 224 aa  94.4  9e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  52.83 
 
 		 210 aa  92  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  44.35 
 
 		 292 aa  88.6  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0583  blue (type 1) copper domain protein  46.46 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  46.6 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0645  blue (type 1) copper domain protein  45.45 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375984  normal  0.285724 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  40.43 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  40 
 
 		 119 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  40 
 
 		 119 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  35.51 
 
 		 807 aa  59.3  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  40.45 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  35.35 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  33.33 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  40.43 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  35.29 
 
 		 110 aa  54.3  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  36.28 
 
 		 116 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  40.24 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  38.78 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  36 
 
 		 137 aa  52.8  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  29.08 
 
 		 235 aa  52.4  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  35.4 
 
 		 116 aa  52  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  34.02 
 
 		 97 aa  52  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  35.4 
 
 		 116 aa  52  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  31.43 
 
 		 140 aa  51.6  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0575  blue (type 1) copper domain protein  37.37 
 
 		 141 aa  51.6  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.093408  normal  0.720315 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3552  blue (type 1) copper domain protein  35.37 
 
 		 119 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  41.77 
 
 		 136 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  35.4 
 
 		 116 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  34.91 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  39.36 
 
 		 126 aa  50.1  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2424  blue (type 1) copper domain protein  34.34 
 
 		 146 aa  48.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  42.86 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  34.69 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  32.61 
 
 		 119 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  34.41 
 
 		 116 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  35.06 
 
 		 119 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  34.41 
 
 		 116 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  37.08 
 
 		 120 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  37.33 
 
 		 72 aa  45.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  36.78 
 
 		 119 aa  45.1  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  34.09 
 
 		 147 aa  44.7  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  32.65 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  30.23 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  36.71 
 
 		 124 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  30.77 
 
 		 123 aa  43.5  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  31.11 
 
 		 114 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  29.91 
 
 		 111 aa  42.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  31.65 
 
 		 85 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  35.53 
 
 		 97 aa  42.4  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  35 
 
 		 161 aa  42  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  31.63 
 
 		 148 aa  42.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  33.02 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  35.53 
 
 		 264 aa  41.6  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  35.23 
 
 		 150 aa  41.6  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  31.03 
 
 		 173 aa  41.6  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  32.22 
 
 		 109 aa  41.6  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  34.38 
 
 		 147 aa  41.6  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0152  plastocyanin  31.07 
 
 		 143 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>