More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1044 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1044  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 233 aa  479  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2013  HhH-GPD family protein  80.26 
 
 		 236 aa  384  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.367934 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.81 
 
 		 222 aa  161  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  43.98 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  44.21 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4286  HhH-GPD family protein  39.81 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0797  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.32 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1733  HhH-GPD family protein  33.01 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.361007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.91 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0980  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.32 
 
 		 232 aa  119  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000905623  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.27 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2290  HhH-GPD  39.22 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  36.17 
 
 		 203 aa  112  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  34.59 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  34.59 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  34.62 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  39.13 
 
 		 235 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  37.56 
 
 		 211 aa  108  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2840  HhH-GPD family protein  37.02 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465492  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2718  HhH-GPD family protein  37.5 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.74745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2386  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.93 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453145  hitchhiker  0.00478293 
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  36.61 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  36.89 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3106  endonuclease III  36.81 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5333  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.82 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  36.26 
 
 		 260 aa  105  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  36.61 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3695  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  34.31 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2945  Endonuclease III FCL domain protein  35.91 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.590508  hitchhiker  0.00145788 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  39.25 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0880  endonuclease III  37.1 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000630803  hitchhiker  0.000000662064 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.36 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.64 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  33.88 
 
 		 221 aa  101  9e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  38.55 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  38.55 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.61 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  38.17 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  39.01 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  36.07 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  34.95 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  33.82 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  35.84 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  35.47 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  34.97 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  34.97 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  36.07 
 
 		 249 aa  99.4  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  34.97 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  34.97 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  33.18 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  34.97 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  34.97 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4249  endonuclease III  37.36 
 
 		 249 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884041  normal  0.624306 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  36.07 
 
 		 209 aa  99.8  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  33.51 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  34.97 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.13 
 
 		 211 aa  99.4  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  35.52 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  34.76 
 
 		 220 aa  99  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  35.79 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  36.99 
 
 		 248 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  36.54 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  36.96 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2122  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.02 
 
 		 212 aa  98.2  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134945  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  34.97 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  33.51 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  34.93 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.07 
 
 		 210 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1316  endonuclease III  33.33 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  33.33 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3680  endonuclease III  39.34 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  34.07 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  37.08 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  35.07 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  32.7 
 
 		 211 aa  96.3  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  33.69 
 
 		 211 aa  96.3  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1844  endonuclease III  34.97 
 
 		 213 aa  96.3  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000031535  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3749  endonuclease III  38.8 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  35.75 
 
 		 212 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  36.17 
 
 		 219 aa  96.3  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.17 
 
 		 219 aa  96.3  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  33.65 
 
 		 212 aa  96.3  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  35.39 
 
 		 223 aa  95.9  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.98 
 
 		 230 aa  95.9  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0829  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  35.42 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.141999  normal  0.027211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  34.95 
 
 		 220 aa  95.5  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17641  putative endonuclease  34.33 
 
 		 217 aa  95.5  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2500  endonuclease III  33.62 
 
 		 240 aa  95.5  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666144  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3412  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.66 
 
 		 239 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.396422 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  37.63 
 
 		 225 aa  95.1  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  36.17 
 
 		 214 aa  95.1  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.58 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  33.87 
 
 		 208 aa  94.7  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3611  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.43 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  35.96 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  35.27 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  32.24 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2072  endonuclease III  34.97 
 
 		 213 aa  94.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  35.11 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  33.5 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>