265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0657 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 
214 aa  422  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  61.43 
 
 
227 aa  250  1e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  60.38 
 
 
226 aa  246  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  62.26 
 
 
225 aa  241  3.9999999999999997e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  55.45 
 
 
232 aa  228  6e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.54 
 
 
227 aa  170  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  49.2 
 
 
235 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  48.69 
 
 
236 aa  166  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.09 
 
 
234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  47.34 
 
 
239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  43.72 
 
 
223 aa  160  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.09 
 
 
240 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  43.4 
 
 
227 aa  158  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  44.19 
 
 
237 aa  155  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.48 
 
 
216 aa  154  7e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  41.78 
 
 
218 aa  154  9e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  46.43 
 
 
221 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.36 
 
 
233 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  43.26 
 
 
230 aa  152  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  42.33 
 
 
227 aa  151  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  45.45 
 
 
229 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  42.19 
 
 
237 aa  148  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.25 
 
 
237 aa  148  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.45 
 
 
218 aa  148  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.16 
 
 
221 aa  142  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.25 
 
 
232 aa  142  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  37.91 
 
 
217 aa  142  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  42.16 
 
 
234 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  39.34 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  37.09 
 
 
218 aa  136  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.54 
 
 
220 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.44 
 
 
238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  39.79 
 
 
228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.79 
 
 
218 aa  133  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  37.69 
 
 
240 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  38.27 
 
 
224 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  37.69 
 
 
240 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  37.69 
 
 
240 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.45 
 
 
229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.84 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  38.74 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  41.27 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  38.22 
 
 
242 aa  125  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  38.02 
 
 
240 aa  126  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  38.14 
 
 
221 aa  125  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.18 
 
 
240 aa  124  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  40 
 
 
251 aa  124  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  34.62 
 
 
236 aa  123  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  34.93 
 
 
237 aa  121  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  38.83 
 
 
230 aa  121  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  41.11 
 
 
214 aa  121  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  41.11 
 
 
214 aa  121  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  39.66 
 
 
226 aa  121  9e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  37 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0962  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.86 
 
 
161 aa  119  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0606985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0293  iron-dependent repressor  42.22 
 
 
214 aa  117  9e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.19 
 
 
227 aa  117  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  37.5 
 
 
224 aa  116  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  36.04 
 
 
230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  35.14 
 
 
230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  35.91 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  35.14 
 
 
230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  35.14 
 
 
230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  34.84 
 
 
229 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.48 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  33.94 
 
 
229 aa  108  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  35.33 
 
 
235 aa  108  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.48 
 
 
230 aa  107  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  37.63 
 
 
244 aa  107  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.24 
 
 
239 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.71 
 
 
239 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  35.75 
 
 
231 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.04 
 
 
229 aa  105  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.98 
 
 
224 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  29.73 
 
 
220 aa  105  7e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.52 
 
 
219 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.43 
 
 
236 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  37.37 
 
 
255 aa  102  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.34 
 
 
237 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.59 
 
 
235 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  34.57 
 
 
234 aa  102  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.29 
 
 
231 aa  101  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.78 
 
 
233 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.68 
 
 
232 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  35.53 
 
 
228 aa  99.4  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  32.06 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  31.6 
 
 
229 aa  97.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  35.38 
 
 
226 aa  97.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  34.39 
 
 
234 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.44 
 
 
234 aa  97.4  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  42.86 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.94 
 
 
227 aa  96.7  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  32.18 
 
 
231 aa  96.7  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  33.93 
 
 
241 aa  96.3  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  35.94 
 
 
232 aa  95.9  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.95 
 
 
238 aa  95.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  33.62 
 
 
236 aa  94.4  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  35.08 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.04 
 
 
240 aa  93.6  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  32.11 
 
 
254 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>