More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1248 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
210 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.68 
 
 
218 aa  247  9e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.71 
 
 
253 aa  239  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.21 
 
 
206 aa  238  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  53.43 
 
 
211 aa  218  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  53.43 
 
 
211 aa  218  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.39 
 
 
208 aa  216  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.73 
 
 
214 aa  213  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.2 
 
 
209 aa  208  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  54.95 
 
 
204 aa  207  8e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1612  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.38 
 
 
210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4177  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.66 
 
 
211 aa  194  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0667192  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.26 
 
 
208 aa  194  7e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.22 
 
 
238 aa  191  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0433342  normal  0.463741 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  52.53 
 
 
220 aa  191  8e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.53 
 
 
220 aa  191  8e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3816  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.76 
 
 
224 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114421  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1474  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.76 
 
 
224 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368115  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.56 
 
 
207 aa  186  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54 
 
 
200 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0542744  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1898  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.8 
 
 
224 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000558815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1509  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.82 
 
 
211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75134  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.31 
 
 
206 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  47.83 
 
 
206 aa  180  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.54 
 
 
220 aa  179  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.83 
 
 
206 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.76 
 
 
203 aa  176  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  50.51 
 
 
220 aa  175  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  52.06 
 
 
214 aa  175  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.76 
 
 
202 aa  174  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  46.27 
 
 
201 aa  173  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.37 
 
 
206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.31 
 
 
204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.77 
 
 
201 aa  171  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.29 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  43.63 
 
 
213 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0645  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.59 
 
 
206 aa  147  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0485  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.59 
 
 
206 aa  147  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18294  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.56 
 
 
208 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.62 
 
 
210 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.36 
 
 
210 aa  142  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.65 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.65 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1318  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.39 
 
 
214 aa  138  6e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1060  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.39 
 
 
244 aa  138  6e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.962837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.27 
 
 
221 aa  138  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 
216 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.57 
 
 
192 aa  134  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.1 
 
 
207 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.65 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130364  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2947  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.64 
 
 
212 aa  125  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.1 
 
 
238 aa  119  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0286  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.26 
 
 
212 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2153  transport protein TolQ-like  37.56 
 
 
474 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.337835  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  33.65 
 
 
229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.69 
 
 
576 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000125272  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.55 
 
 
339 aa  114  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  38.81 
 
 
234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0536  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.48 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0848  TolR-like transport protein  36.55 
 
 
470 aa  108  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.638917  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.82 
 
 
216 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.8 
 
 
218 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.65 
 
 
204 aa  101  6e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.372688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.99 
 
 
236 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.435369  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.48 
 
 
237 aa  99  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0548  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.02 
 
 
263 aa  99  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.477361  normal  0.119792 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.37 
 
 
478 aa  97.8  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00882438  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2347  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.97 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.0518868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.9 
 
 
257 aa  95.5  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4455  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.37 
 
 
226 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.28 
 
 
263 aa  94  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.426551  normal  0.407525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.65 
 
 
209 aa  93.2  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1721  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.23 
 
 
241 aa  93.2  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0001524  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0453  biopolymer transport proteins-like  35.44 
 
 
465 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.8 
 
 
235 aa  92  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.53 
 
 
236 aa  90.9  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  30.85 
 
 
228 aa  90.9  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2154  biopolymer transport protein (ExbB)-like  31.9 
 
 
208 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.41 
 
 
226 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156891  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3579  biopolymer transport protein  35.53 
 
 
234 aa  90.1  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.159406  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.68 
 
 
200 aa  89.7  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4310  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.84 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4446  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.84 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.84 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163965  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3131  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.26 
 
 
274 aa  89.4  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1654  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.5 
 
 
480 aa  89.4  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.759397  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.11 
 
 
251 aa  88.6  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0966  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.03 
 
 
206 aa  88.6  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271628  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.55 
 
 
171 aa  88.2  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.86 
 
 
252 aa  88.2  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0290  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.86 
 
 
252 aa  88.2  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.225424  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2300  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.21 
 
 
215 aa  88.2  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.81 
 
 
199 aa  88.2  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0268  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.37 
 
 
252 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4055  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.5 
 
 
279 aa  86.3  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.072513  hitchhiker  0.00000250214 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  31.35 
 
 
224 aa  85.9  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  31.35 
 
 
224 aa  85.9  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3563  ATPase  34.21 
 
 
220 aa  85.9  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.363023  normal  0.586206 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0262  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.95 
 
 
243 aa  85.9  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0861801  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1153  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  46.9 
 
 
457 aa  85.1  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>