149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0213 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  100 
 
 		 118 aa  236  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  43.33 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  42.86 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  45.35 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  44.05 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  44.71 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  44.05 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  41.49 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  41.49 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  40.43 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  44.05 
 
 		 118 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  44.05 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  44.05 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  40.48 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  44.05 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  40.86 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  44.05 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  40.86 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  39.29 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  42.86 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  44.05 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  42.86 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  42.86 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  45.35 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  38.3 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  41.67 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  41 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  41.18 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  45.35 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  40.45 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  41.33 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  41.33 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  43.53 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  38.82 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  40.24 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  38.82 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  36.9 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  35.71 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  39.77 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  41.89 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  34.88 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  40 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  44.74 
 
 		 82 aa  60.1  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  30.85 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  36.84 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  43.24 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  40.51 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  39.19 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  38.71 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  38.1 
 
 		 81 aa  50.4  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  36.92 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  36.92 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  36.92 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1515  glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  35.48 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3740  glutaredoxin-like protein  40.98 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  37.7 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  33.87 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4334  glutaredoxin  24.69 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.33 
 
 		 284 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  36.07 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  35.48 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  41.38 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  35.59 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  35.59 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4121  glutaredoxin-like protein  39.34 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  35.59 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  29.51 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  29.51 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  35.59 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  37.33 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  29.51 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  29.51 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  34.55 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  36 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  29.87 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  33.9 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0664  glutaredoxin 3  32.81 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  38.16 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  33.87 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  32.81 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0418  GrxC family glutaredoxin  32.81 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616611  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  32.81 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  32.81 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  32.81 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  32.81 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  32.81 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  29.63 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3808  glutaredoxin-like protein  33.85 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  29.63 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  35.59 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  37.66 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04215  glutaredoxin Grx1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06100)  34.62 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  28 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  33.8 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  42.31 
 
 		 402 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  29.51 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  30.91 
 
 		 84 aa  42.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  30.91 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  33.87 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>