239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2947 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2947  NUDIX hydrolase  100 
 
 
163 aa  338  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0320  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 
169 aa  163  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2673  ADP-ribose pyrophosphatase  50.31 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2130  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 
175 aa  131  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7147  NUDIX hydrolase  42.94 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0778185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4486  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 
169 aa  114  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2139  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 
188 aa  72  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  38.04 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  30.25 
 
 
170 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  36.84 
 
 
164 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
177 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  40 
 
 
182 aa  58.9  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  30.67 
 
 
183 aa  58.5  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  40 
 
 
198 aa  58.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  26.25 
 
 
171 aa  58.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 
185 aa  58.2  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 
182 aa  57.8  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 
190 aa  57.4  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
150 aa  57.4  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 
181 aa  57.4  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 
170 aa  57.4  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
187 aa  57  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0240  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  45.21 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
187 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 
187 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 
171 aa  55.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  35.79 
 
 
181 aa  55.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1884  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  34.09 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187986  normal  0.072132 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 
163 aa  55.1  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 
164 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 
185 aa  54.7  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  37 
 
 
181 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
187 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
187 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 
182 aa  54.3  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  40.85 
 
 
150 aa  54.3  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0721  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
157 aa  53.9  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.267739 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 
184 aa  53.9  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 
182 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 
182 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  39.47 
 
 
181 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 
187 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  30.36 
 
 
184 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
212 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 
183 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
181 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  36.96 
 
 
177 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
201 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 
166 aa  53.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  33.67 
 
 
187 aa  52.4  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
187 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 
179 aa  52.4  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 
187 aa  52  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  34 
 
 
187 aa  52.4  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  34.62 
 
 
187 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
194 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
154 aa  51.6  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.47 
 
 
181 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  39.47 
 
 
181 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  39.47 
 
 
181 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  39.47 
 
 
181 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.47 
 
 
181 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  39.47 
 
 
181 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.47 
 
 
181 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.47 
 
 
181 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 
320 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 
153 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  54.76 
 
 
303 aa  50.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  48.39 
 
 
346 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
196 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  41.25 
 
 
345 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
198 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  48.39 
 
 
346 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 
298 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  48.39 
 
 
346 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  48.39 
 
 
346 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  35.16 
 
 
183 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  42.25 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
184 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  28.05 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>