More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2306 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2306  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  461  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  44 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 228 aa  205  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.09 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  44.8 
 
 		 230 aa  202  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 231 aa  202  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  45 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 228 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.25 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  45.09 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  43.95 
 
 		 227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 229 aa  198  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 229 aa  198  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 		 235 aa  198  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  42.15 
 
 		 228 aa  197  7.999999999999999e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 228 aa  197  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 236 aa  195  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 232 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 236 aa  195  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 236 aa  194  9e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 231 aa  194  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1488  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 223 aa  192  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1986  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 242 aa  192  4e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 227 aa  191  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  42.86 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  43.86 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.5 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0905  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  41.44 
 
 		 231 aa  189  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 230 aa  188  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 226 aa  188  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1104  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1085  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.49 
 
 		 235 aa  187  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 237 aa  187  9e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1215  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.72 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0337  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0475  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.69 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0489  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.69 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210896  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  42.98 
 
 		 243 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.89 
 
 		 229 aa  185  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 222 aa  185  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  42.54 
 
 		 244 aa  185  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 226 aa  185  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  42.54 
 
 		 243 aa  185  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  42.54 
 
 		 243 aa  185  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 231 aa  185  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  42.54 
 
 		 243 aa  185  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 234 aa  185  6e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 234 aa  184  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 240 aa  184  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0151  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 241 aa  184  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 226 aa  184  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  42.42 
 
 		 245 aa  184  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 230 aa  183  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.95 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  40.27 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.78 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  40.09 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2121  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  40.87 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>