105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0396 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0396  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  100 
 
 		 170 aa  335  9.999999999999999e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0206  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  37.5 
 
 		 179 aa  90.5  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3636  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.65 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34297  normal  0.130415 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0276  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.94 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0311412  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3655  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.22 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0283  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.94 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3579  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.59 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3615  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.59 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.190854 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3510  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.59 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3508  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.59 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3677  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.59 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.148558 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2635  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.86 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3027  hypothetical protein  32.86 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0507  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.88 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3393  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.88 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3688  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.88 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0500  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.88 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.850542  normal  0.391623 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3496  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.88 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3570  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.88 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4522  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.88 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.599849  normal  0.710923 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0925  OstA-like protein  32.61 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1489  OstA-like protein  31.88 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0428752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4314  OstA family protein  25.35 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.257817 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03065  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  26.34 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000332715  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0157  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.43 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.503776 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03016  hypothetical protein  26.34 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000479332  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3813  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.95 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.277414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2168  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.4 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0570  OstA family protein  28.78 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2791  OstA-like protein  31.41 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127705  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0825  cell envelope biogenesis YhbN  30.43 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4365  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.43 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.201613  normal  0.154984 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57920  hypothetical protein  29.82 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  25.32 
 
 		 221 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5033  hypothetical protein  28.07 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0234887  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4261  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.66 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0753  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.97 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.703312  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12810  LPS transport protein LptA  29.57 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2427  OstA family protein  24.43 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0150816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2890  OstA family protein  25.28 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.745795  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0961  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.95 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5924  OstA family protein  21.89 
 
 		 239 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657817  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0535  OstA-like family protein  29.8 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.872333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0657  OstA-like protein  23.75 
 
 		 219 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5469  OstA family protein  23.73 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12141  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0954  hypothetical protein  28.07 
 
 		 174 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2974  OstA family protein  26.7 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000275423  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0993  cell envelope biogenesis YhbN  28.07 
 
 		 174 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  22.64 
 
 		 221 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2499  OstA family protein  23.78 
 
 		 242 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.241313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3614  cell envelope biogenesis YhbN  28.65 
 
 		 179 aa  51.2  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0599225  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0507  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.66 
 
 		 181 aa  51.2  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970543  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0140  OstA-like protein  26.7 
 
 		 176 aa  50.8  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0443  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.95 
 
 		 181 aa  50.8  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1151  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.95 
 
 		 181 aa  50.8  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  24.07 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4451  ostA family protein  26.55 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.953915  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4145  OstA-like protein  26.32 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  26.06 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2722  OstA family protein  23.21 
 
 		 246 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0177  OstA-like protein  21.88 
 
 		 228 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2224  OstA-like protein  26.95 
 
 		 174 aa  48.5  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1175  hypothetical protein  29.5 
 
 		 172 aa  48.1  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0123  hypothetical protein  23.08 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0308315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02229  hypothetical protein  28.26 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.70202  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4541  OstA family protein  29.55 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0872  OstA family protein  26.32 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0206259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03662  hypothetical protein  26.09 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0709  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.46 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686411  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0728  OstA-like protein  24.65 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0173  OstA-like protein  22.22 
 
 		 227 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0417  OstA-like protein  23.21 
 
 		 225 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3666  OstA family protein  27.41 
 
 		 184 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000733032  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0717  OstA family protein  26.57 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0688  cell envelope biogenesis YhbN  27.41 
 
 		 184 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00274419  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0168  OstA family protein  23.78 
 
 		 216 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0718  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.41 
 
 		 184 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.460129 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3177  alpha amylase domain-containing protein  26.72 
 
 		 179 aa  44.3  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3309  OstA family protein  30 
 
 		 181 aa  44.3  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000684229  normal  0.786006 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2228  OstA family protein  23.24 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0368  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.27 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.166234 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2416  cell envelope biogenesis YhbN  26.32 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.0334942 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0500  hypothetical protein  25.18 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.108043  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3375  OstA family protein  29.25 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.25365  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0674  OstA family protein  27.41 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.20726  normal  0.0960529 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4956  OstA family protein  30.12 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4169  hypothetical protein  22.9 
 
 		 180 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3249  OstA-like protein  25.69 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0107  OstA family protein  25 
 
 		 180 aa  42.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.587032 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2606  OstA family protein  22.63 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2107  hypothetical protein  25.71 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0859  OstA-like protein  27.82 
 
 		 181 aa  42  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.492596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0675  OstA family protein  27.41 
 
 		 183 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.155422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3347  OstA family protein  27.41 
 
 		 183 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00730418  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4238  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.54 
 
 		 196 aa  42  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000789736 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03191  OstA-like protein  25.55 
 
 		 184 aa  42  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1940  hypothetical protein  19.42 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.946021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3392  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.4 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0226  OstA-like protein  19.05 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0728  OstA family protein  26.03 
 
 		 217 aa  41.6  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.201644 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>