70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0177 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0177  OstA-like protein  100 
 
 
228 aa  458  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0173  OstA-like protein  74.46 
 
 
227 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  77.01 
 
 
221 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0657  OstA-like protein  69.19 
 
 
219 aa  277  8e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0417  OstA-like protein  65.93 
 
 
225 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  73.06 
 
 
221 aa  261  8e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0123  hypothetical protein  72.68 
 
 
225 aa  258  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0308315  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  49.18 
 
 
230 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5469  OstA family protein  40.26 
 
 
223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12141  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5924  OstA family protein  38.01 
 
 
239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657817  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2427  OstA family protein  37.28 
 
 
250 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0150816  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0151  hypothetical protein  39.87 
 
 
216 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0300186  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0168  OstA family protein  40 
 
 
216 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2499  OstA family protein  36.47 
 
 
242 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.241313 
 
 
-
 
NC_004310  BR0156  hypothetical protein  39.33 
 
 
204 aa  99.8  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2722  OstA family protein  35.63 
 
 
246 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0046  OstA family protein  38.36 
 
 
211 aa  99  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0406  cell envelope biogenesis protein YhbN  37.19 
 
 
187 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3669  OstA-like protein  39.16 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1369  OstA family protein  33.54 
 
 
200 aa  97.4  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.524769  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0570  OstA family protein  36.77 
 
 
212 aa  96.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0194  cell envelope biogenesis YhbN  36.69 
 
 
197 aa  95.9  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106383  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0017  OstA family protein  36.65 
 
 
186 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0062  OstA family protein  33.68 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5273  OstA family protein  29.34 
 
 
285 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0157  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  34.46 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.503776 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0226  OstA-like protein  30.92 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4956  OstA family protein  32.43 
 
 
196 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2606  OstA family protein  31.64 
 
 
161 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1155  OstA-like protein  30.77 
 
 
163 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2816  OstA family protein  30.77 
 
 
163 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3249  OstA-like protein  31.25 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2341  OstA-like protein  27.17 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3586  OstA family protein  29.61 
 
 
170 aa  72  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2772  OstA family protein  31.41 
 
 
168 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0012  hypothetical protein  32.24 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.541863  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2905  OstA family protein  30.6 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358104  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0107  OstA family protein  29.87 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.587032 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1672  OstA family protein  33.8 
 
 
323 aa  60.1  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2791  OstA-like protein  26.45 
 
 
275 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127705  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1603  OstA family protein  27.56 
 
 
181 aa  55.8  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0025  OstA-like protein  28.1 
 
 
144 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00942039  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2071  OstA family protein  28.76 
 
 
199 aa  51.6  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437606  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0152  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.58 
 
 
175 aa  51.6  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2168  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.58 
 
 
182 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3336  OstA family protein  28.68 
 
 
179 aa  49.3  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0396  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  21.88 
 
 
170 aa  49.7  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0728  OstA-like protein  26.09 
 
 
180 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1309  hypothetical protein  29.31 
 
 
614 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0453765  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0140  OstA-like protein  23.6 
 
 
176 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57920  hypothetical protein  27.63 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  26.02 
 
 
169 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0429  OstA family protein  26.63 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.034618 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0206  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  20 
 
 
179 aa  46.2  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5033  hypothetical protein  25.66 
 
 
175 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0234887  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0535  OstA-like family protein  26.53 
 
 
177 aa  46.2  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.872333  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12810  LPS transport protein LptA  24.18 
 
 
184 aa  46.2  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0972  OstA family protein  28.44 
 
 
174 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000111121  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0336  OstA family protein  32.89 
 
 
362 aa  45.8  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0497543  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2713  OstA family protein  25.47 
 
 
188 aa  45.8  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  24.39 
 
 
167 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1350  OstA family protein  27.14 
 
 
153 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0752  OstA family protein  27.86 
 
 
153 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.52807  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0877  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.71 
 
 
180 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000011507  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0677  OstA family protein  27.86 
 
 
153 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.25138  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5033  OstA family protein  29.17 
 
 
833 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.589653 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  30.86 
 
 
705 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3708  OstA family protein  26.17 
 
 
214 aa  42.4  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0872  OstA family protein  24.67 
 
 
181 aa  42.4  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0206259  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2974  OstA family protein  25.98 
 
 
169 aa  42.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000275423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>