89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0199 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 		 230 aa  479  1e-134  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  65.52 
 
 		 219 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  40.79 
 
 		 208 aa  158  9e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  39.46 
 
 		 223 aa  154  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  41.07 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  38.26 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  37.12 
 
 		 216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  35.68 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  37.22 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  36.89 
 
 		 214 aa  139  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  37.78 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  36.12 
 
 		 212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  38.57 
 
 		 258 aa  134  8e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  36.61 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  36.68 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  37.05 
 
 		 211 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  35.87 
 
 		 217 aa  132  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 214 aa  131  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  36.28 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  36.73 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  35.53 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  34.53 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  37.5 
 
 		 202 aa  125  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  35.96 
 
 		 218 aa  125  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  36.48 
 
 		 221 aa  121  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  34.58 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  34.6 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  36.23 
 
 		 200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 		 202 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 		 202 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 		 202 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  33.91 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  47.95 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  27.7 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  26.52 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  29.78 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  27.7 
 
 		 356 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  30.9 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02083  phosphoglycerate mutase family protein, putative  28.57 
 
 		 259 aa  49.3  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  46.15 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 274 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 402 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  43.48 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  30.23 
 
 		 180 aa  48.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 204 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  30.34 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  42.03 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  26.04 
 
 		 411 aa  46.6  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  28.33 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  26.36 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  44.93 
 
 		 241 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  27.53 
 
 		 198 aa  45.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  41.1 
 
 		 223 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  30.9 
 
 		 412 aa  45.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  40.58 
 
 		 233 aa  45.4  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  24.76 
 
 		 370 aa  45.4  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  24.72 
 
 		 200 aa  45.1  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  26.23 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  39.19 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  28.05 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  36.99 
 
 		 391 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  37.68 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  26.45 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  26 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5917  phosphoglycerate mutase  25.67 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  23.46 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  41.54 
 
 		 218 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  25.79 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  26.03 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  26.22 
 
 		 226 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  28.19 
 
 		 224 aa  42.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  26.03 
 
 		 229 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  25.83 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0838  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 219 aa  41.6  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000172405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>